RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 MAST1Q9Y2H9 1570 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 GPR182O15218 404 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 PCSK2P16519 638 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 MAPK1P28482 360 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 TXKP42681 527 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 PREPP48147 710 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 ARL4DP49703 201 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 NLRP12P59046 1061 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 DSC3Q14574 896 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 BEND4Q6ZU67 534 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 DTX1Q86Y01 620 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 GJD3Q8N144 294 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 AFAP1Q8N556 730 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 SHKBP1Q8TBC3 707 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 PMEPA1Q969W9 287 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 ASB16Q96NS5 453 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 FAM129BQ96TA1 746 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 SOX13Q9UN79 622 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 SHANK2Q9UPX8 1470 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 MYOM3Q5VTT5 1437 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 MEGF11A6BM72 1044 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 UNCXA6NJT0 531 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 ADAMTS4O75173 837 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 TRPA1O75762 1119 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 FDX2Q6P4F2 183 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 SLC7A3Q8WY07 619 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 HHIPQ96QV1 700 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 SETDB2Q96T68 719 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 RNF19AQ9NV58 838 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 NCOA2Q15596 1464 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 NLRP1Q9C000 1473 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 MBD5Q9P267 1494 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 C8orf34Q49A92 452 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 TTC16Q8NEE8 873 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 CHRDQ9H2X0 955 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 MYO3AQ8NEV4 1616 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 NCOA1Q15788 1441 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 PZPP20742 1482 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 WNT11O96014 354 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 P4HBP07237 508 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 HGSNATQ68CP4 663 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 NXPE3Q969Y0 559 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 ZMYM3Q14202 1370 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 ERBINQ96RT1 1412 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 A2ML1A8K2U0 1454 aa6.41□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 DUOX2Q9NRD8 1548 aa6.41□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 WDR64B1ANS9 1081 aa6.41□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 TREHO43280 583 aa6.41□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.41□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 BSNDQ8WZ55 320 aa6.41□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 OSMRQ99650 979 aa6.41□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 BRPF3Q9ULD4 1205 aa6.41□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 KANK1Q14678 1352 aa6.41□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 CPS1P31327 1500 aa6.4□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 DEPDC5O75140 1603 aa6.4□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 IKBKEQ14164 716 aa6.4□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 MLECQ14165 292 aa6.4□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.4□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 GIMAP7Q8NHV1 300 aa6.4□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.4□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.4□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.4□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 WWC3Q9ULE0 1092 aa6.4□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 EREGO14944 169 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 AAMPQ13685 434 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 SGO2Q562F6 1265 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 NUTM2GQ5VZR2 741 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 CYP4F12Q9HCS2 524 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 PIM2Q9P1W9 311 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 PTPRKQ15262 1439 aa6.39□□□□□ -1.39
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