RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522926.1

TNIP1-216, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene TNIP1, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1-216ENST00000522926 SIL1Q9H173 461 aa22.91■■□□□ 1.26
TNIP1-216ENST00000522926 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.91■■□□□ 1.26
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TNIP1-216ENST00000522926 MGAMO43451 1857 aa22.9■■□□□ 1.26
TNIP1-216ENST00000522926 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TNIP1-216ENST00000522926 SGPL1O95470 568 aa22.9■■□□□ 1.26
TNIP1-216ENST00000522926 INHAP05111 366 aa22.9■■□□□ 1.26
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TNIP1-216ENST00000522926 IDI2Q9BXS1 227 aa22.88■■□□□ 1.25
TNIP1-216ENST00000522926 NR2E3Q9Y5X4 410 aa22.88■■□□□ 1.25
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TNIP1-216ENST00000522926 DOCK2Q92608 1830 aa22.86■■□□□ 1.25
TNIP1-216ENST00000522926 PTPRFP10586 1907 aa22.85■■□□□ 1.25
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TNIP1-216ENST00000522926 TREML2Q5T2D2 321 aa22.84■■□□□ 1.25
TNIP1-216ENST00000522926 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
TNIP1-216ENST00000522926 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.84■■□□□ 1.25
TNIP1-216ENST00000522926 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.84■■□□□ 1.25
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TNIP1-216ENST00000522926 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.84■■□□□ 1.25
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TNIP1-216ENST00000522926 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.84■■□□□ 1.25
TNIP1-216ENST00000522926 EVI5O60447 810 aa22.83■■□□□ 1.25
TNIP1-216ENST00000522926 CIAO1O76071 339 aa22.83■■□□□ 1.25
TNIP1-216ENST00000522926 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.83■■□□□ 1.25
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TNIP1-216ENST00000522926 FBXO3Q9UK99 471 aa22.8■■□□□ 1.24
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TNIP1-216ENST00000522926 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
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TNIP1-216ENST00000522926 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
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TNIP1-216ENST00000522926 ZBTB22O15209 634 aa22.77■■□□□ 1.24
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TNIP1-216ENST00000522926 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.77■■□□□ 1.24
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TNIP1-216ENST00000522926 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
TNIP1-216ENST00000522926 GDF15Q99988 308 aa22.76■■□□□ 1.23
TNIP1-216ENST00000522926 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
TNIP1-216ENST00000522926 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.75■■□□□ 1.23
TNIP1-216ENST00000522926 SPP2Q13103 211 aa22.75■■□□□ 1.23
TNIP1-216ENST00000522926 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.75■■□□□ 1.23
TNIP1-216ENST00000522926 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.75■■□□□ 1.23
TNIP1-216ENST00000522926 COPRSQ9NQ92 184 aa22.75■■□□□ 1.23
TNIP1-216ENST00000522926 GJD2Q9UKL4 321 aa22.75■■□□□ 1.23
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