RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521038.5

PHF20L1-217, Transcript of PHD finger protein 20 like 1, human

TSL 5

Gene PHF20L1, Length 427 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF20L1-217	ENST00000521038	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		6.7	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		6.7	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		6.7	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		6.7	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	TMX1	Q9H3N1	280 aa		6.7	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		6.7	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	TOMM22	Q9NS69	142 aa		6.7	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		6.7	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	CDC23	Q9UJX2	597 aa		6.7	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	TSPOAP1	O95153	1857 aa		6.7	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		6.7	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	NR1I2	O75469	434 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	GNAI2	P04899	355 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	CTAGE8	P0CG41	777 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	C14orf37	Q86TY3	774 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	TTC6	Q86TZ1	520 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	CNNM3	Q8NE01	707 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	CARD6	Q9BX69	1037 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	ETAA1	Q9NY74	926 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	MCM8	Q9UJA3	840 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	DNAJB2	P25686	324 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	AK2	P54819	239 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	CASP8	Q14790	479 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	PPP2R5A	Q15172	486 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	WASHC4	Q2M389	1173 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	LRRC31	Q6UY01	552 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	RUFY3	Q7L099	469 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	CCDC102A	Q96A19	550 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	HYPK	Q9NX55	129 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	ABCC3	O15438	1527 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	CTAGE9	A4FU28	777 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	CUTA	O60888	179 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	YEATS4	O95619	227 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	SLC10A3	P09131	477 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	RPIA	P49247	311 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	GYS2	P54840	703 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	SKOR1	P84550	965 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	ITIH3	Q06033	890 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	SCRN1	Q12765	414 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	TMED1	Q13445	227 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	TRIM14	Q14142	442 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	EMC10	Q5UCC4	262 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	ALS2CL	Q60I27	953 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
PHF20L1-217	ENST00000521038	IQCA1	Q86XH1	822 aa		6.67	□□□□□ -1.34

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