RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-223ENST00000515011 TRIM37O94972 964 aa26.65■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 ST5P78524 1137 aa26.65■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 WTAPQ15007 396 aa26.65■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa26.65■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 IGSF3O75054 1194 aa26.64■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 SERPINB2P05120 415 aa26.64■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 MAP3K11Q16584 847 aa26.64■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 MYL10Q9BUA6 226 aa26.64■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 CLSTN2Q9H4D0 955 aa26.64■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 STK36Q9NRP7 1315 aa26.64■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 PRDX5P30044 214 aa26.64■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 RCAN1P53805 252 aa26.64■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa26.64■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 TMTC2Q8N394 836 aa26.64■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 ALG1Q9BT22 464 aa26.64■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 ERICH2A1L162 156 aa26.63■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 PCP11498 1178 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa26.63■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 ESR2Q92731 530 aa26.63■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 RTEL1Q9NZ71 1219 aa26.63■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 NR1I2O75469 434 aa26.62■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC192P0DO97 292 aa26.62■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 SLC51AQ86UW1 340 aa26.62■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa26.62■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 TNMDQ9H2S6 317 aa26.62■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 GJB4Q9NTQ9 266 aa26.62■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 LAMB1P07942 1786 aa26.62■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 FGRP09769 529 aa26.61■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 STK11IPQ8N1F8 1099 aa26.61■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 PHKBQ93100 1093 aa26.61■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 UBAC1Q9BSL1 405 aa26.61■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 IFNAR1P17181 557 aa26.6■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 MYSM1Q5VVJ2 828 aa26.6■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 CTR9Q6PD62 1173 aa26.6■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 AIFM3Q96NN9 605 aa26.6■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 ESPNB1AK53 854 aa26.6■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 KIF28PB7ZC32 967 aa26.6■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 SEC23AQ15436 765 aa26.6■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 HS1BP3Q53T59 392 aa26.6■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 WDR66Q8TBY9 1149 aa26.6■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 POLR3EQ9NVU0 708 aa26.6■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 SMIM22K7EJ46 135 aa26.59■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 CAMK4Q16566 473 aa26.59■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF804AQ7Z570 1209 aa26.59■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa26.59■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa26.58■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 YEATS4O95619 227 aa26.58■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 DDR1Q08345 913 aa26.58■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 RTN1Q16799 776 aa26.58■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 TXNRD1Q16881 649 aa26.58■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 KRT40Q6A162 431 aa26.58■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 GPSM2P81274 684 aa26.58■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF654Q8IZM8 581 aa26.58■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
PDE4D-223ENST00000515011 TNKSO95271 1327 aa26.57■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 PROM2Q8N271 834 aa26.57■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 LINC00301Q8NCQ3 95 aa26.57■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 JAG2Q9Y219 1238 aa26.57■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.57■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 USP17L12C9JPN9 530 aa26.57■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 USP17L21D6R901 530 aa26.57■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP26.57■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa26.56■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 ME1P48163 572 aa26.56■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 KCNG4Q8TDN1 519 aa26.56■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 WASF1Q92558 559 aa26.56■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 SLC26A6Q9BXS9 759 aa26.56■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa26.56■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 ATP2B4P23634 1241 aa26.56■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 TYRO3Q06418 890 aa26.56■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 SBK1Q52WX2 424 aa26.56■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 CLIC4Q9Y696 253 aa26.56■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 ORC4O43929 436 aa26.55■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 LDHBP07195 334 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa26.55■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 BBOX1O75936 387 aa26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms