RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 LIFRP42702 1097 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 ANO1Q5XXA6 986 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 ADGRA1Q86SQ6 560 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 WASF1Q92558 559 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 AKAP11Q9UKA4 1901 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 SLC10A5Q5PT55 438 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00301Q8NCQ3 95 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 LAMA4Q16363 1823 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 KIF28PB7ZC32 967 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 ADALQ6DHV7 355 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 SGMS1Q86VZ5 419 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 IQCA1Q86XH1 822 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 JMYQ8N9B5 988 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 CNBD1Q8NA66 436 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 STAG1Q8WVM7 1258 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF804BA4D1E1 1349 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 USP17L12C9JPN9 530 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 USP17L21D6R901 530 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 BCL9LQ86UU0 1499 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A087WWV3 80 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 YEATS4O95619 227 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 STX1AQ16623 288 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF654Q8IZM8 581 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 UBE2Q2LH0YL09 131 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 MECOMQ03112 1051 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 POLR3EQ9NVU0 708 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 ANO10Q9NW15 660 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 KCNJ14Q9UNX9 436 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 TNKSO95271 1327 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 BIN1O00499 593 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 PRDX5P30044 214 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 NDUFA8P51970 172 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 KLHL34Q8N239 644 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 FBXO33Q7Z6M2 555 aa12.77□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 CATIPQ7Z7H3 387 aa12.77□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 SEPT12Q8IYM1 358 aa12.77□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 CEP57L1Q8IYX8 460 aa12.77□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 FANCBQ8NB91 859 aa12.77□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 TACC3Q9Y6A5 838 aa12.77□□□□□ -0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 MYH7P12883 1935 aa12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 SMIM22K7EJ46 135 aa12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 PIBF1Q8WXW3 757 aa12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 SEMA3EO15041 775 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 IFNAR1P17181 557 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 XBP1P17861 261 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 USP5P45974 858 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 NRAPQ86VF7 1730 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 AFF2P51816 1311 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 BTBD18B2RXH4 712 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 NFIXQ14938 502 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 MTMR7Q9Y216 660 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 CAVIN2O95810 425 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 ISM2Q6H9L7 571 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 TXNRD3Q86VQ6 643 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 AMIGO3Q86WK7 504 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 MCM9Q9NXL9 1143 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A1W2PQ27 194 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A1W2PQ64 194 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A1W2PQD8 194 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 AP5Z1O43299 807 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 OFD1O75665 1012 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 NTRK3Q16288 839 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 NWD2Q9ULI1 1742 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF202O95125 648 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 DEXIO95424 95 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 GUCY1A2P33402 732 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 SLC39A14Q15043 492 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 AMOTL1Q8IY63 956 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 WNK3Q9BYP7 1800 aa12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms