RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 OPTNQ96CV9 577 aa25.64■■□□□ 1.7
SH3BP2-210ENST00000505941 GPATCH3Q96I76 525 aa25.64■■□□□ 1.7
SH3BP2-210ENST00000505941 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
SH3BP2-210ENST00000505941 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP25.64■■□□□ 1.7
SH3BP2-210ENST00000505941 RHBDL3P58872 404 aa25.63■■□□□ 1.69
SH3BP2-210ENST00000505941 VGLL4Q14135 290 aa25.63■■□□□ 1.69
SH3BP2-210ENST00000505941 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.63■■□□□ 1.69
SH3BP2-210ENST00000505941 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
SH3BP2-210ENST00000505941 TNS4Q8IZW8 715 aa25.63■■□□□ 1.69
SH3BP2-210ENST00000505941 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.63■■□□□ 1.69
SH3BP2-210ENST00000505941 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
SH3BP2-210ENST00000505941 ALDH1A1P00352 501 aa25.62■■□□□ 1.69
SH3BP2-210ENST00000505941 PPP4CP60510 307 aa25.62■■□□□ 1.69
SH3BP2-210ENST00000505941 ZFPM1Q8IX07 1006 aa25.62■■□□□ 1.69
SH3BP2-210ENST00000505941 MAGEB6Q8N7X4 407 aa25.62■■□□□ 1.69
SH3BP2-210ENST00000505941 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa25.62■■□□□ 1.69
SH3BP2-210ENST00000505941 ATP5JP18859 108 aa25.61■■□□□ 1.69
SH3BP2-210ENST00000505941 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
SH3BP2-210ENST00000505941 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.61■■□□□ 1.69
SH3BP2-210ENST00000505941 GOLIM4O00461 696 aa25.6■■□□□ 1.69
SH3BP2-210ENST00000505941 ERO1BQ86YB8 467 aa25.6■■□□□ 1.69
SH3BP2-210ENST00000505941 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
SH3BP2-210ENST00000505941 BOLA2Q9H3K6 86 aa25.6■■□□□ 1.69
SH3BP2-210ENST00000505941 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
SH3BP2-210ENST00000505941 OTUD5Q96G74 571 aa25.59■■□□□ 1.69
SH3BP2-210ENST00000505941 GTF2A2P52657 109 aa25.58■■□□□ 1.69
SH3BP2-210ENST00000505941 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa25.58■■□□□ 1.69
SH3BP2-210ENST00000505941 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.58■■□□□ 1.697e-9■■■□□ 15.3
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SH3BP2-210ENST00000505941 ECHDC1Q9NTX5 307 aa25.58■■□□□ 1.69
SH3BP2-210ENST00000505941 PAG1Q9NWQ8 432 aa25.58■■□□□ 1.69
SH3BP2-210ENST00000505941 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa25.57■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.57■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 RFX7Q2KHR2 1363 aa25.56■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 MAST2Q6P0Q8 1798 aa25.56■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 SPDYE5A6NIY4 337 aa25.56■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 ADGRA1Q86SQ6 560 aa25.56■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 IFNL1Q8IU54 200 aa25.56■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 HAUS7Q99871 368 aa25.56■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.681e-7■■■■□ 21.3
SH3BP2-210ENST00000505941 PICK1Q9NRD5 415 aa25.56■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 INPP5BP32019 993 aa25.55■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 USP5P45974 858 aa25.55■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 PPATQ06203 517 aa25.55■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa25.55■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 MIGA1Q8NAN2 632 aa25.55■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIM34Q9BYJ4 488 aa25.55■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa25.55■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 TBC1D12O60347 775 aa25.54■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 TBC1D8O95759 1140 aa25.54■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 GJA5P36382 358 aa25.54■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa25.54■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 GCC1Q96CN9 775 aa25.54■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 PI4KBQ9UBF8 816 aa25.54■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 ATRNL1Q5VV63 1379 aa25.54■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa25.53■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 MAP3K10Q02779 954 aa25.53■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 PPIL2Q13356 520 aa25.53■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 SNAPC2Q13487 334 aa25.53■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa25.53■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25.53■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa25.52■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 CETPP11597 493 aa25.52■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 PDE6AP16499 860 aa25.52■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 CCL15Q16663 113 aa25.52■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 OTOFQ9HC10 1997 aa25.52■■□□□ 1.68
SH3BP2-210ENST00000505941 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-210ENST00000505941 ERC2O15083 957 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-210ENST00000505941 HLA-DOAP06340 250 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-210ENST00000505941 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-210ENST00000505941 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-210ENST00000505941 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-210ENST00000505941 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-210ENST00000505941 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-210ENST00000505941 PHF20L1A8MW92 1017 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-210ENST00000505941 IRF6O14896 467 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-210ENST00000505941 FLT1P17948 1338 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-210ENST00000505941 DOCK2Q92608 1830 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-210ENST00000505941 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-210ENST00000505941 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF532Q9HCE3 1301 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-210ENST00000505941 IFFO2Q5TF58 517 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-210ENST00000505941 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-210ENST00000505941 CFHR5Q9BXR6 569 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-210ENST00000505941 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-210ENST00000505941 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-210ENST00000505941 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-210ENST00000505941 PALD1Q9ULE6 856 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-210ENST00000505941 GPR25O00155 361 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-210ENST00000505941 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
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