RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502470.5

MIB2-215, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 5

Gene MIB2, Length 780 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-215	ENST00000502470	LDHC	P07864	332 aa		33.24	■■■□□ 2.91
MIB2-215	ENST00000502470	GTF2A2	P52657	109 aa		33.24	■■■□□ 2.91
MIB2-215	ENST00000502470	PICALM	Q13492	652 aa		33.24	■■■□□ 2.91
MIB2-215	ENST00000502470	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		33.24	■■■□□ 2.91
MIB2-215	ENST00000502470	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		33.24	■■■□□ 2.91
MIB2-215	ENST00000502470	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		33.23	■■■□□ 2.91
MIB2-215	ENST00000502470	FKTN	O75072	461 aa		33.23	■■■□□ 2.91
MIB2-215	ENST00000502470	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
MIB2-215	ENST00000502470	CCL15	Q16663	113 aa		33.23	■■■□□ 2.91
MIB2-215	ENST00000502470	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		33.23	■■■□□ 2.91
MIB2-215	ENST00000502470	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	33.22	■■■□□ 2.91
MIB2-215	ENST00000502470	ZAP70	P43403	619 aa		33.22	■■■□□ 2.91
MIB2-215	ENST00000502470	CRHR2	Q13324	411 aa		33.22	■■■□□ 2.91
MIB2-215	ENST00000502470	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		33.22	■■■□□ 2.91
MIB2-215	ENST00000502470	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	33.22	■■■□□ 2.91
MIB2-215	ENST00000502470	IRF6	O14896	467 aa		33.21	■■■□□ 2.91
MIB2-215	ENST00000502470	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
MIB2-215	ENST00000502470	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		33.21	■■■□□ 2.91
MIB2-215	ENST00000502470	SLURP2	P0DP57	97 aa		33.2	■■■□□ 2.91
MIB2-215	ENST00000502470	PPIL2	Q13356	520 aa		33.2	■■■□□ 2.91
MIB2-215	ENST00000502470	DOCK1	Q14185	1865 aa		33.19	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		33.19	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	AACS	Q86V21	672 aa		33.19	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		33.19	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	PPAT	Q06203	517 aa		33.18	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		33.18	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		33.18	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		33.17	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	PDE3A	Q14432	1141 aa		33.17	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		33.16	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	MAP3K10	Q02779	954 aa		33.16	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	SNAPC2	Q13487	334 aa		33.16	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	APBB1	O00213	710 aa		33.15	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	HMMR	O75330	724 aa		33.15	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	CETP	P11597	493 aa		33.15	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		33.15	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	33.15	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		33.15	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	SIPA1L1	O43166	1804 aa		33.14	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		33.14	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	TEX11	Q8IYF3	940 aa		33.14	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	PTPRF	P10586	1907 aa		33.14	■■■□□ 2.9
MIB2-215	ENST00000502470	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
MIB2-215	ENST00000502470	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		33.13	■■■□□ 2.89
MIB2-215	ENST00000502470	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	33.12	■■■□□ 2.89
MIB2-215	ENST00000502470	BTBD19	C9JJ37	291 aa		33.12	■■■□□ 2.89
MIB2-215	ENST00000502470	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
MIB2-215	ENST00000502470	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	33.12	■■■□□ 2.89
MIB2-215	ENST00000502470	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		33.11	■■■□□ 2.89
MIB2-215	ENST00000502470	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		33.11	■■■□□ 2.89
MIB2-215	ENST00000502470	BAG3	O95817	575 aa		33.1	■■■□□ 2.89
MIB2-215	ENST00000502470	PPP4C	P60510	307 aa		33.1	■■■□□ 2.89
MIB2-215	ENST00000502470	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		33.1	■■■□□ 2.89
MIB2-215	ENST00000502470	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		33.1	■■■□□ 2.89
MIB2-215	ENST00000502470	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		33.1	■■■□□ 2.89
MIB2-215	ENST00000502470	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
MIB2-215	ENST00000502470	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		33.09	■■■□□ 2.89
MIB2-215	ENST00000502470	FAM196B	A6NMK8	535 aa		33.08	■■■□□ 2.89
MIB2-215	ENST00000502470	IGSF3	O75054	1194 aa		33.08	■■■□□ 2.89
MIB2-215	ENST00000502470	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
MIB2-215	ENST00000502470	SP3	Q02447	781 aa		33.08	■■■□□ 2.89
MIB2-215	ENST00000502470	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	33.08	■■■□□ 2.89
MIB2-215	ENST00000502470	TRIM17	Q9Y577	477 aa		33.08	■■■□□ 2.89
MIB2-215	ENST00000502470	MYH1	P12882	1939 aa		33.08	■■■□□ 2.89
MIB2-215	ENST00000502470	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		33.07	■■■□□ 2.89
MIB2-215	ENST00000502470	TBC1D12	O60347	775 aa		33.07	■■■□□ 2.88
MIB2-215	ENST00000502470	RAB11FIP3	O75154	756 aa		33.07	■■■□□ 2.88
MIB2-215	ENST00000502470	CAP1	Q01518	475 aa		33.07	■■■□□ 2.88
MIB2-215	ENST00000502470	ERO1A	Q96HE7	468 aa		33.07	■■■□□ 2.88
MIB2-215	ENST00000502470	BCL11A	Q9H165	835 aa		33.07	■■■□□ 2.88
MIB2-215	ENST00000502470	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.88
MIB2-215	ENST00000502470	PLCG2	P16885	1265 aa		33.06	■■■□□ 2.88
MIB2-215	ENST00000502470	CYP7A1	P22680	504 aa		33.06	■■■□□ 2.88
MIB2-215	ENST00000502470	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	33.06	■■■□□ 2.88
MIB2-215	ENST00000502470	MOGS	Q13724	837 aa		33.06	■■■□□ 2.88
MIB2-215	ENST00000502470	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		33.06	■■■□□ 2.88
MIB2-215	ENST00000502470	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	33.06	■■■□□ 2.88
MIB2-215	ENST00000502470	PICK1	Q9NRD5	415 aa		33.06	■■■□□ 2.88
MIB2-215	ENST00000502470	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
MIB2-215	ENST00000502470	PTPRA	P18433	802 aa		33.05	■■■□□ 2.88
MIB2-215	ENST00000502470	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		33.05	■■■□□ 2.88
MIB2-215	ENST00000502470	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		33.05	■■■□□ 2.88
MIB2-215	ENST00000502470	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
MIB2-215	ENST00000502470	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		33.05	■■■□□ 2.88
MIB2-215	ENST00000502470	HTT	P42858	3142 aa		33.05	■■■□□ 2.88
MIB2-215	ENST00000502470	RGS19	P49795	217 aa		33.04	■■■□□ 2.88
MIB2-215	ENST00000502470	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		33.04	■■■□□ 2.88
MIB2-215	ENST00000502470	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
MIB2-215	ENST00000502470	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		33.03	■■■□□ 2.88
MIB2-215	ENST00000502470	FLT1	P17948	1338 aa		33.02	■■■□□ 2.88
MIB2-215	ENST00000502470	CXCL11	O14625	94 aa		33.02	■■■□□ 2.88

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