RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498524.5

ANKRD28-213, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 LDHBP07195 334 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 MYBPC2Q14324 1141 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM117AQ9C073 453 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 LRRCC1Q9C099 1032 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 DBNDD1Q9H9R9 158 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 RAI14Q9P0K7 980 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 SEMA3EO15041 775 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 FIBPO43427 364 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 TPM4P67936 248 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 GTF2IP78347 998 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 DDR1Q08345 913 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 DOK7Q18PE1 504 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 ERC1Q8IUD2 1116 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 MYOZ2Q9NPC6 264 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 PDCP20941 246 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 WWC2Q6AWC2 1192 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 DPP9Q86TI2 863 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 PDCL2Q8N4E4 241 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 CEP120Q8N960 986 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 NUDT12Q9BQG2 462 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 LRP2BPQ9P2M1 347 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 PTPRCP08575 1304 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 BECN2A8MW95 431 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 F8W031 263 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 FZD9O00144 591 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 CXCL11O14625 94 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 STK10O94804 968 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 SDSP20132 328 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 PAX3P23760 479 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 EPS15P42566 896 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 USP5P45974 858 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 AP5M1Q9H0R1 490 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 RBSNQ9H1K0 784 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 RNF186Q9NXI6 227 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 KLHL42Q9P2K6 505 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 CCDC66A2RUB6 948 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 UBE2Q2LH0YL09 131 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC10A3P09131 477 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 GRK4P32298 578 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 RGS2P41220 211 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 PDE4DQ08499 809 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 RNF20Q5VTR2 975 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 TAF3Q5VWG9 929 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 CCDC24Q8N4L8 307 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 ANKRD44Q8N8A2 993 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 TMX3Q96JJ7 454 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 DCTPP1Q9H773 170 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 USP25Q9UHP3 1055 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 TRIM35Q9UPQ4 493 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 PLCH1Q4KWH8 1693 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 ALDH1L1O75891 902 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 CAMTA2O94983 1202 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 MX1P20591 662 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 UBE4AQ14139 1066 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 KIAA0825Q8IV33 1275 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 BICD2Q8TD16 824 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 USP26Q9BXU7 913 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 NACAP1Q9BZK3 213 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 LMBRD1Q9NUN5 540 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 HPS5Q9UPZ3 1129 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 ANKLE1Q8NAG6 615 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 PPLO60437 1756 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF804BA4D1E1 1349 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 MYPNQ86TC9 1320 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 H3BQV1 296 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 VAMP4O75379 141 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 MAPK4P31152 587 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 IL13P35225 146 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 KRT85P78386 507 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 RAB30Q15771 203 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC10A5Q5PT55 438 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 TTC39AQ5SRH9 613 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF280DQ6N043 979 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF662Q6ZS27 426 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 ZBTB33Q86T24 672 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 TRIM5Q9C035 493 aa4.54□□□□□ -1.68
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