RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498438.1

HOXD11-202, Transcript of homeobox D11, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HOXD11, Length 1,259 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-202ENST00000498438 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.49■■□□□ 1.19
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HOXD11-202ENST00000498438 RAB11FIP3O75154 756 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXD11-202ENST00000498438 ALDH1A1P00352 501 aa22.48■■□□□ 1.19
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HOXD11-202ENST00000498438 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.19
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HOXD11-202ENST00000498438 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
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HOXD11-202ENST00000498438 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
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HOXD11-202ENST00000498438 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.44■■□□□ 1.18
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HOXD11-202ENST00000498438 IRF6O14896 467 aa22.43■■□□□ 1.18
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HOXD11-202ENST00000498438 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
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HOXD11-202ENST00000498438 MYH1P12882 1939 aa22.35■■□□□ 1.17
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HOXD11-202ENST00000498438 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD11-202ENST00000498438 PDE6AP16499 860 aa22.34■■□□□ 1.17
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