RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SKAP2-209	ENST00000497511	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SKAP2-209	ENST00000497511	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SKAP2-209	ENST00000497511	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SKAP2-209	ENST00000497511	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	JUND	P17535	347 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	DLGAP5	Q15398	846 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	ERO1A	Q96HE7	468 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	GREM2	Q9H772	168 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	FZD1	Q9UP38	647 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	GTF2I	P78347	998 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	MYO1B	O43795	1136 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	GNAI1	P63096	354 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	EFCC1	Q9HA90	598 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	RPIA	P49247	311 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	DESI1	Q6ICB0	168 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR7	Q8TB68	274 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	WNK4	Q96J92	1243 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	VEZT	Q9HBM0	779 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	IFT57	Q9NWB7	429 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511		F8W031	263 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	13.85	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	KSR2	Q6VAB6	950 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	CLRN2	A0PK11	232 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	KLRK1	P26718	216 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	13.84	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	SP3	Q02447	781 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	CRHR2	Q13324	411 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGEF6	Q15052	776 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	STK31	Q9BXU1	1019 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	PSME4	Q14997	1843 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV5-2	P06315	115 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	ITGA6	P23229	1130 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP3K11	Q16584	847 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	UNCX	A6NJT0	531 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF853	P0CG23	659 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	CFAP100	Q494V2	611 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	NBPF11	Q86T75	865 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	ARMC5	Q96C12	935 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	CD209	Q9NNX6	404 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	LILRB3	O75022	631 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	CHRND	Q07001	517 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	GOPC	Q9HD26	462 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	APAF1	O14727	1248 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	13.8	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPRN	Q16849	979 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2

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