RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496204.1

RAD50-208, Transcript of RAD50 double strand break repair protein, human

TSL 3

Gene RAD50, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD50-208	ENST00000496204	KCNB2	Q92953	911 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD50-208	ENST00000496204	ISL2	Q96A47	359 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD50-208	ENST00000496204	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAD50-208	ENST00000496204	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD50-208	ENST00000496204	PIDD1	Q9HB75	910 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD50-208	ENST00000496204	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	ENC1	O14682	589 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	PAGE1	O75459	146 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	NME2	P22392	152 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	MAPK1	P28482	360 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	ERVK-24	P63145	666 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	BNIP3	Q12983	259 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	RASIP1	Q5U651	963 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	PAPLN	O95428	1278 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	OXCT1	P55809	520 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	RING1	Q06587	406 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	RNF214	Q8ND24	703 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	CD96	P40200	585 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	OGFOD2	Q6N063	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	NETO1	Q8TDF5	533 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	CD8B	P10966	210 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	GSTT1	P30711	240 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	FBF1	Q8TES7	1133 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	MISP3	Q96FF7	219 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	ASB16	Q96NS5	453 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	BTBD11	A6QL63	1104 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	FBXO24	O75426	580 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	TRIM37	O94972	964 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	FUT4	P22083	530 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	PRKCQ	Q04759	706 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	PPM1J	Q5JR12	505 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	VAV3	Q9UKW4	847 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	CSAD	Q9Y600	493 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	CEACAM5	P06731	702 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	MAPK8	P45983	427 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	PLCL1	Q15111	1095 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	C12orf40	Q86WS4	652 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	ASIC4	Q96FT7	647 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	CBX8	Q9HC52	389 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD50-208	ENST00000496204	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD50-208	ENST00000496204	GIPC1	O14908	333 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD50-208	ENST00000496204	CELA3A	P09093	270 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD50-208	ENST00000496204	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
RAD50-208	ENST00000496204	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAD50-208	ENST00000496204	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD50-208	ENST00000496204	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD50-208	ENST00000496204	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAD50-208	ENST00000496204	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD50-208	ENST00000496204	CEP44	Q9C0F1	390 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD50-208	ENST00000496204	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD50-208	ENST00000496204	FANCG	O15287	622 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD50-208	ENST00000496204	EOMES	O95936	686 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD50-208	ENST00000496204	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD50-208	ENST00000496204	INPP5A	Q14642	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD50-208	ENST00000496204	AOC3	Q16853	763 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD50-208	ENST00000496204	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD50-208	ENST00000496204	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD50-208	ENST00000496204	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD50-208	ENST00000496204	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD50-208	ENST00000496204	C12orf49	Q9H741	205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD50-208	ENST00000496204	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63

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