RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 ERVK-24P63145 666 aa8.26□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 GPBAR1Q8TDU6 330 aa8.26□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 CD97P48960 835 aa8.25□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 DAB2P98082 770 aa8.25□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 CYP27C1Q4G0S4 372 aa8.25□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 ELMO3Q96BJ8 720 aa8.25□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.25□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 SORBS3O60504 671 aa8.24□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 F13BP05160 661 aa8.24□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 CELA3AP09093 270 aa8.24□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 BMP6P22004 513 aa8.24□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 TTLL4Q14679 1199 aa8.24□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.24□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 TMC4Q7Z404 712 aa8.24□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 KCT2Q8NC54 265 aa8.24□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 RNF214Q8ND24 703 aa8.24□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 STK35Q8TDR2 534 aa8.24□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 PCDHA4Q9UN74 947 aa8.24□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 CYP26A1O43174 497 aa8.23□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 PAGE1O75459 146 aa8.23□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 RPS26P62854 115 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 TTBK2Q6IQ55 1244 aa8.23□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 DISC1Q9NRI5 854 aa8.23□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa8.23□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 PRR19A6NJB7 356 aa8.22□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 FOSL1P15407 271 aa8.22□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 ST13P50502 369 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 CDC37L1Q7L3B6 337 aa8.22□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.22□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 VTI1BQ9UEU0 232 aa8.22□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 HDXQ7Z353 690 aa8.21□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 FBXO33Q7Z6M2 555 aa8.21□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.21□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa8.21□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 CRELD1Q96HD1 420 aa8.21□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 BCL2L13Q9BXK5 485 aa8.21□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.21□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 FANCGO15287 622 aa8.2□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 OGFOD3Q6PK18 319 aa8.2□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.2□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 LGR6Q9HBX8 967 aa8.2□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 ADMP35318 185 aa8.19□□□□□ -1.1
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RBM39-241ENST00000496183 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa8.19□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 C1GALT1Q9NS00 363 aa8.19□□□□□ -1.1
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RBM39-241ENST00000496183 DCDC2CA8MYV0 355 aa8.18□□□□□ -1.1
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RBM39-241ENST00000496183 ISL2Q96A47 359 aa8.18□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa8.18□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa8.18□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 LIG3P49916 1009 aa8.17□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 PWP1Q13610 501 aa8.17□□□□□ -1.1
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RBM39-241ENST00000496183 ZNF507Q8TCN5 953 aa8.17□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 GATA6Q92908 595 aa8.17□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 CSADQ9Y600 493 aa8.17□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.16□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa8.16□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 FAM87AP0C7U9 286 aa8.16□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 SPINK2P20155 84 aa8.16□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 CDK5R2Q13319 367 aa8.16□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 MAP3K11Q16584 847 aa8.16□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 MEI1Q5TIA1 1274 aa8.16□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 AGMOQ6ZNB7 445 aa8.16□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 USP31Q70CQ4 1352 aa8.16□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 C12orf40Q86WS4 652 aa8.16□□□□□ -1.1
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RBM39-241ENST00000496183 NEFMP07197 916 aa8.15□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 ETF1P62495 437 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 ZBTB37Q5TC79 503 aa8.15□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa8.15□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 VSIG10LQ86VR7 867 aa8.15□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 GIPC2Q8TF65 315 aa8.15□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 FAM161BQ96MY7 647 aa8.15□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 RNF19AQ9NV58 838 aa8.15□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 TACC3Q9Y6A5 838 aa8.15□□□□□ -1.1
RBM39-241ENST00000496183 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RBM39-241ENST00000496183 RELL1Q8IUW5 271 aa8.14□□□□□ -1.11
RBM39-241ENST00000496183 STK11IPQ8N1F8 1099 aa8.14□□□□□ -1.11
RBM39-241ENST00000496183 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.14□□□□□ -1.11
RBM39-241ENST00000496183 MED26O95402 600 aa8.13□□□□□ -1.11
RBM39-241ENST00000496183 BPNT1O95861 308 aa8.13□□□□□ -1.11
RBM39-241ENST00000496183 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
RBM39-241ENST00000496183 PDE4BQ07343 736 aa8.13□□□□□ -1.11
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