RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493607.1

SERBP1-208, Transcript of SERPINE1 mRNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene SERBP1, Length 615 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERBP1-208	ENST00000493607	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		28.51	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	28.51	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	ABHD8	Q96I13	439 aa		28.51	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	SNRK	Q9NRH2	765 aa		28.51	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		28.5	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	28.5	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	TBC1D8	O95759	1140 aa		28.5	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	ZAP70	P43403	619 aa		28.5	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	PPP4C	P60510	307 aa		28.5	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	28.5	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		28.5	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		28.49	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	GPR25	O00155	361 aa		28.49	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	PPAT	Q06203	517 aa		28.49	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	28.49	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	28.49	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	BAG3	O95817	575 aa		28.48	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	PLCG2	P16885	1265 aa		28.48	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	PPIL2	Q13356	520 aa		28.48	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		28.48	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	28.48	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		28.48	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	28.48	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	TBC1D12	O60347	775 aa		28.47	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	DGKZ	Q13574	1117 aa		28.47	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	28.47	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		28.47	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	OTUD5	Q96G74	571 aa		28.47	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	PTPN18	Q99952	460 aa		28.47	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	28.47	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		28.47	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	INPP5B	P32019	993 aa		28.46	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	28.46	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	CERS3	Q8IU89	383 aa		28.46	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	28.46	■■■□□ 2.15
SERBP1-208	ENST00000493607	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	28.45	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		28.45	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	28.45	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		28.45	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	28.45	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	CETP	P11597	493 aa		28.44	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	28.44	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	DOCK1	Q14185	1865 aa		28.44	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		28.43	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	IRF6	O14896	467 aa		28.43	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	FKTN	O75072	461 aa		28.43	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	SNAPC2	Q13487	334 aa		28.43	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	PICALM	Q13492	652 aa		28.43	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	28.43	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	CCL15	Q16663	113 aa		28.43	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	TEX11	Q8IYF3	940 aa		28.43	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		28.43	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	28.42	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	28.42	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		28.42	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	MAP3K12	Q12852	859 aa		28.41	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		28.41	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	28.41	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	28.41	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	28.4	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	CAPN15	O75808	1086 aa		28.4	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	CRHR2	Q13324	411 aa		28.4	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		28.4	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	28.4	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		28.39	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	28.39	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	28.39	■■■□□ 2.14
SERBP1-208	ENST00000493607	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		28.38	■■■□□ 2.13
SERBP1-208	ENST00000493607	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		28.38	■■■□□ 2.13
SERBP1-208	ENST00000493607	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	28.38	■■■□□ 2.13
SERBP1-208	ENST00000493607	SIPA1L1	O43166	1804 aa		28.38	■■■□□ 2.13
SERBP1-208	ENST00000493607	PTPRF	P10586	1907 aa		28.37	■■■□□ 2.13
SERBP1-208	ENST00000493607	APBB1	O00213	710 aa		28.37	■■■□□ 2.13
SERBP1-208	ENST00000493607	CXCL11	O14625	94 aa		28.37	■■■□□ 2.13
SERBP1-208	ENST00000493607	CYP7A1	P22680	504 aa		28.37	■■■□□ 2.13
SERBP1-208	ENST00000493607	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		28.37	■■■□□ 2.13
SERBP1-208	ENST00000493607	DCTPP1	Q9H773	170 aa		28.37	■■■□□ 2.13
SERBP1-208	ENST00000493607	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	28.36	■■■□□ 2.13
SERBP1-208	ENST00000493607	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		28.36	■■■□□ 2.13
SERBP1-208	ENST00000493607	PICK1	Q9NRD5	415 aa		28.36	■■■□□ 2.13
SERBP1-208	ENST00000493607	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		28.36	■■■□□ 2.13
SERBP1-208	ENST00000493607	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		28.36	■■■□□ 2.13
SERBP1-208	ENST00000493607	PTPRA	P18433	802 aa		28.35	■■■□□ 2.13
SERBP1-208	ENST00000493607	ATP5J	P18859	108 aa		28.35	■■■□□ 2.13
SERBP1-208	ENST00000493607	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	28.35	■■■□□ 2.13
SERBP1-208	ENST00000493607	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		28.35	■■■□□ 2.13
SERBP1-208	ENST00000493607	FLT1	P17948	1338 aa		28.35	■■■□□ 2.13
SERBP1-208	ENST00000493607	MYH1	P12882	1939 aa		28.35	■■■□□ 2.13
SERBP1-208	ENST00000493607	BTBD19	C9JJ37	291 aa		28.34	■■■□□ 2.13
SERBP1-208	ENST00000493607	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		28.34	■■■□□ 2.13
SERBP1-208	ENST00000493607	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		28.34	■■■□□ 2.13
SERBP1-208	ENST00000493607	ERO1A	Q96HE7	468 aa		28.34	■■■□□ 2.13
SERBP1-208	ENST00000493607	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	28.34	■■■□□ 2.13
SERBP1-208	ENST00000493607	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		28.34	■■■□□ 2.13
SERBP1-208	ENST00000493607	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	28.33	■■■□□ 2.13
SERBP1-208	ENST00000493607	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		28.33	■■■□□ 2.13
SERBP1-208	ENST00000493607	MYH7	P12883	1935 aa		28.32	■■■□□ 2.12
SERBP1-208	ENST00000493607	SP3	Q02447	781 aa		28.32	■■■□□ 2.12
SERBP1-208	ENST00000493607	MOGS	Q13724	837 aa		28.32	■■■□□ 2.12
SERBP1-208	ENST00000493607	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		28.32	■■■□□ 2.12

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