RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		6.94	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		6.94	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	GPR108	Q9NPR9	543 aa		6.94	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		6.94	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		6.94	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		6.94	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	SPEF2	Q9C093	1822 aa		6.94	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	LRP5	O75197	1615 aa		6.94	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		6.94	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	ABCC12	Q96J65	1359 aa		6.94	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A1B0GUL7	405 aa		6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730		M0R2C6	588 aa		6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	GOLIM4	O00461	696 aa		6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	BBOX1	O75936	387 aa		6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	RPS6KB1	P23443	525 aa		6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	CRY2	Q49AN0	593 aa		6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	OLFM4	Q6UX06	510 aa		6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	PI16	Q6UXB8	463 aa		6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	RBSN	Q9H1K0	784 aa		6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	MTMR6	Q9Y217	621 aa		6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		6.93	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	TAF1	P21675	1872 aa		6.92	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	HIP1	O00291	1037 aa		6.92	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	CYP21A2	P08686	494 aa		6.92	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	SYT1	P21579	422 aa		6.92	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	GJB2	P29033	226 aa		6.92	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	GMPR	P36959	345 aa		6.92	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF445	P59923	1031 aa		6.92	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		6.92	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		6.92	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	USP48	Q86UV5	1035 aa		6.92	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		6.92	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	OSBP2	Q969R2	916 aa		6.92	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	XAGE2	Q96GT9	111 aa		6.92	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	GREM2	Q9H772	168 aa		6.92	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		6.92	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		6.92	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		6.92	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	MAST3	O60307	1309 aa		6.92	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A1B0GUL6	1792 aa		6.92	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		6.91	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		6.91	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	SNAP23	O00161	211 aa		6.91	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	F13A1	P00488	732 aa		6.91	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	PTMS	P20962	102 aa		6.91	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	ITGA6	P23229	1130 aa		6.91	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	ZAP70	P43403	619 aa		6.91	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	MRE11	P49959	708 aa		6.91	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	CTSW	P56202	376 aa		6.91	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	GRAP	Q13588	217 aa		6.91	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		6.91	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		6.91	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		6.91	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC51A	Q86UW1	340 aa		6.91	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	SP8	Q8IXZ3	490 aa		6.91	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		6.91	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		6.91	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		6.91	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	TSKS	Q9UJT2	592 aa		6.91	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	LAMB2	P55268	1798 aa		6.9	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		6.9	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		6.9	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	STX6	O43752	255 aa		6.9	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	JAK2	O60674	1132 aa		6.9	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	COPS2	P61201	443 aa		6.9	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		6.9	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		6.9	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		6.9	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	MPND	Q8N594	471 aa		6.9	□□□□□ -1.3

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms