RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa14.93□□□□□ -0.02
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PRAME-213ENST00000492657 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PRAME-213ENST00000492657 SLC26A6Q9BXS9 759 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-213ENST00000492657 RAI14Q9P0K7 980 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-213ENST00000492657 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
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PRAME-213ENST00000492657 SLC12A7Q9Y666 1083 aa14.93□□□□□ -0.02
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PRAME-213ENST00000492657 A0A1W2PQ64 194 aa14.92□□□□□ -0.02
PRAME-213ENST00000492657 A0A1W2PQD8 194 aa14.92□□□□□ -0.02
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PRAME-213ENST00000492657 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PRAME-213ENST00000492657 PRIMPOLQ96LW4 560 aa14.89□□□□□ -0.03
PRAME-213ENST00000492657 CNNM2Q9H8M5 875 aa14.89□□□□□ -0.03
PRAME-213ENST00000492657 SPTLC3Q9NUV7 552 aa14.89□□□□□ -0.03
PRAME-213ENST00000492657 ANO10Q9NW15 660 aa14.89□□□□□ -0.03
PRAME-213ENST00000492657 LTBP4Q8N2S1 1624 aa14.89□□□□□ -0.03
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PRAME-213ENST00000492657 MYH2Q9UKX2 1941 aa14.87□□□□□ -0.03
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PRAME-213ENST00000492657 PRDM1O75626 825 aa14.87□□□□□ -0.03
PRAME-213ENST00000492657 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
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PRAME-213ENST00000492657 SHC4Q6S5L8 630 aa14.87□□□□□ -0.03
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