RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	MAST3	O60307	1309 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	KDR	P35968	1356 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	STX10	O60499	249 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	ERCC3	P19447	782 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	GPT	P24298	496 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	CCT5	P48643	541 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	CASP8	Q14790	479 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	ALK	Q9UM73	1620 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	LTK	P29376	864 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	KAZALD1	Q96I82	304 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	CDC23	Q9UJX2	597 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A0U1RQJ8	604 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	EBAG9	O00559	213 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	IKBKB	O14920	756 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	GPAA1	O43292	621 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	KRT9	P35527	623 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	ZAP70	P43403	619 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	FUT8	Q9BYC5	575 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	SAMM50	Q9Y512	469 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	MAP9	Q49MG5	647 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF609	O15014	1411 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	RNF40	O75150	1001 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	PRR29	P0C7W0	189 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	CDC25A	P30304	524 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	VSNL1	P62760	191 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	NCAPH	Q15003	741 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF790	Q6PG37	636 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	SHC4	Q6S5L8	630 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	KCNB2	Q92953	911 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	USP6	P35125	1406 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	SRGAP2	O75044	1071 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	PIP4K2B	P78356	416 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	UBXN1	Q04323	297 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	PPM1E	Q8WY54	764 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	PPL	O60437	1756 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	ADORA1	P30542	326 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	MAP3K9	P80192	1104 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF174	Q15697	407 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC93	Q567U6	631 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	CUTA	O60888	179 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	HOXB7	P09629	217 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	IP6K1	Q92551	441 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	PNKP	Q96T60	521 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	ERBB3	P21860	1342 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	ATP8B1	O43520	1251 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	XBP1	P17861	261 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	NR5A1	Q13285	461 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	STIM1	Q13586	685 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	ICE2	Q659A1	982 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	MED23	Q9ULK4	1368 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	CDC27	P30260	824 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	CHRNA2	Q15822	529 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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