RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 CYP4F12Q9HCS2 524 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNQ5Q9NR82 932 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 AP4E1Q9UPM8 1137 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 CSADQ9Y600 493 aa5.3□□□□□ -1.56
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RABGGTB-211ENST00000489450 DCDC2CA8MYV0 355 aa5.29□□□□□ -1.56
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RABGGTB-211ENST00000489450 ADH5P11766 374 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 DRD2P14416 443 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 PAK2Q13177 524 aa5.29□□□□□ -1.56
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RABGGTB-211ENST00000489450 Q6ZS46 218 aa5.29□□□□□ -1.56
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RABGGTB-211ENST00000489450 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 MEGF10Q96KG7 1140 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 SUGCTQ9HAC7 445 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 UBP1Q9NZI7 540 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 UNC13AQ9UPW8 1703 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 CILPO75339 1184 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 TIAF1O95411 115 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 SLFN14P0C7P3 912 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 ITGB7P26010 798 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 CRKP46108 304 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 PREPP48147 710 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 ID3Q02535 119 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 ANKRD34AQ69YU3 496 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 TXNRD3Q86VQ6 643 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 ELMO3Q96BJ8 720 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 TINF2Q9BSI4 451 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 CAPN10Q9HC96 672 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa5.28□□□□□ -1.56
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RABGGTB-211ENST00000489450 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 SART1O43290 800 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 BPNT1O95861 308 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 DYMQ7RTS9 669 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 C12orf40Q86WS4 652 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 NT5C1AQ9BXI3 368 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 CRIM1Q9NZV1 1036 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 HIF3AQ9Y2N7 669 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 ACTL7BQ9Y614 415 aa5.27□□□□□ -1.57
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RABGGTB-211ENST00000489450 PPM1JQ5JR12 505 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 HDXQ7Z353 690 aa5.26□□□□□ -1.57
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RABGGTB-211ENST00000489450 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 FANCD2OSQ96PS1 177 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 LRRC3Q9BY71 257 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 CEP41Q9BYV8 373 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 DISC1Q9NRI5 854 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 GAS2O43903 313 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 GRIN3BO60391 1043 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 RAB6AP20340 208 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 ASPAP45381 313 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 ERVK-24P63145 666 aa5.25□□□□□ -1.57
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RABGGTB-211ENST00000489450 CYFIP1Q7L576 1253 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 REC114Q7Z4M0 266 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 ARMC10Q8N2F6 343 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 ATXN3LQ9H3M9 355 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 BRMS1Q9HCU9 246 aa5.25□□□□□ -1.57
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RABGGTB-211ENST00000489450 CORINQ9Y5Q5 1042 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 NEFMP07197 916 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 GATA4P43694 442 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 RING1Q06587 406 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 DOC2BQ14184 412 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 SGO2Q562F6 1265 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 CDPF1Q6NVV7 123 aa5.24□□□□□ -1.57
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