RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478932.1

USP25-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP25, Length 2,605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-208ENST00000478932 MYH7P12883 1935 aa4.84□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 RIMBP2O15034 1052 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 MBD3O95983 291 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 UBE2HP62256 183 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 KRT85P78386 507 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
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USP25-208ENST00000478932 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
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USP25-208ENST00000478932 BCORQ6W2J9 1755 aa4.83□□□□□ -1.64
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USP25-208ENST00000478932 LAMA4Q16363 1823 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 LY75O60449 1722 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 SALL1Q9NSC2 1324 aa4.83□□□□□ -1.64
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USP25-208ENST00000478932 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
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USP25-208ENST00000478932 BBOX1O75936 387 aa4.83□□□□□ -1.64
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USP25-208ENST00000478932 ZNF445P59923 1031 aa4.83□□□□□ -1.64
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USP25-208ENST00000478932 CHMP4CQ96CF2 233 aa4.83□□□□□ -1.64
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USP25-208ENST00000478932 SPATA32Q96LK8 384 aa4.83□□□□□ -1.64
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USP25-208ENST00000478932 CD209Q9NNX6 404 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 SLC12A7Q9Y666 1083 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa4.82□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 ZBTB43O43298 467 aa4.82□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 POTEIP0CG38 1075 aa4.82□□□□□ -1.64
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USP25-208ENST00000478932 CYP2D6P10635 497 aa4.82□□□□□ -1.64
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USP25-208ENST00000478932 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP4.82□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 RESTQ13127 1097 aa4.82□□□□□ -1.64
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USP25-208ENST00000478932 MCM9Q9NXL9 1143 aa4.82□□□□□ -1.64
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USP25-208ENST00000478932 PGBD1Q96JS3 809 aa4.82□□□□□ -1.64
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USP25-208ENST00000478932 IARSP41252 1262 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 GTF2IP78347 998 aa4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 WTAPQ15007 396 aa4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 SART3Q15020 963 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 LRSAM1Q6UWE0 723 aa4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
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