RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 RAI14Q9P0K7 980 aa28.71■■■□□ 2.19
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C9orf3-215ENST00000478473 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP28.51■■■□□ 2.154e-8■■■■■ 37.5
C9orf3-215ENST00000478473 HPS5Q9UPZ3 1129 aa28.51■■■□□ 2.15
C9orf3-215ENST00000478473 ZHX2Q9Y6X8 837 aa28.51■■■□□ 2.15
C9orf3-215ENST00000478473 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
C9orf3-215ENST00000478473 OTOP1Q7RTM1 612 aa28.5■■■□□ 2.15
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