RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP16.22■□□□□ 0.19
PRAME-211ENST00000476336 ZNF384Q8TF68 577 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAME-211ENST00000476336 GCC1Q96CN9 775 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAME-211ENST00000476336 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAME-211ENST00000476336 RFX7Q2KHR2 1363 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAME-211ENST00000476336 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
PRAME-211ENST00000476336 NFIAQ12857 509 aa16.21■□□□□ 0.19
PRAME-211ENST00000476336 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
PRAME-211ENST00000476336 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
PRAME-211ENST00000476336 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
PRAME-211ENST00000476336 ATRNL1Q5VV63 1379 aa16.21■□□□□ 0.19
PRAME-211ENST00000476336 OTOFQ9HC10 1997 aa16.2■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa16.2■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 TEX11Q8IYF3 940 aa16.2■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 WNK4Q96J92 1243 aa16.2■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 WRNIP1Q96S55 665 aa16.2■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP16.2■□□□□ 0.181e-17■□□□□ 9.1
PRAME-211ENST00000476336 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 ECHDC1Q9NTX5 307 aa16.2■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 TBC1D12O60347 775 aa16.19■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 CYP7A1P22680 504 aa16.19■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 MAP3K10Q02779 954 aa16.19■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa16.19■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 ERO1BQ86YB8 467 aa16.19■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 HAUS7Q99871 368 aa16.19■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 PAG1Q9NWQ8 432 aa16.19■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP16.19■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 ZNF112Q9UJU3 913 aa16.19■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 FOCADQ5VW36 1801 aa16.19■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 TTC41PQ6P2S7 1318 aa16.19■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 ERC2O15083 957 aa16.18■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 PICALMQ13492 652 aa16.18■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 VGLL4Q14135 290 aa16.18■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 CDAN1Q8IWY9 1227 aa16.18■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 MAGEB6Q8N7X4 407 aa16.18■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 OPTNQ96CV9 577 aa16.18■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 CLMNQ96JQ2 1002 aa16.18■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 FZD1Q9UP38 647 aa16.18■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 SPDYE5A6NIY4 337 aa16.17■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 GOLIM4O00461 696 aa16.17■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 GTF2A2P52657 109 aa16.17■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa16.17■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 MIGA2Q7L4E1 593 aa16.17■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 CFHR5Q9BXR6 569 aa16.17■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 BCL11AQ9H165 835 aa16.17■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 ANTXR1Q9H6X2 564 aa16.17■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 PI4KBQ9UBF8 816 aa16.17■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa16.16■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 PPATQ06203 517 aa16.16■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 BOLA2Q9H3K6 86 aa16.16■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 ELP3Q9H9T3 547 aa16.16■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 MYH7P12883 1935 aa16.15■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 ADGRA1Q86SQ6 560 aa16.15■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 ZFPM1Q8IX07 1006 aa16.15■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa16.15■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 TAOK2Q9UL54 1235 aa16.15■□□□□ 0.18
PRAME-211ENST00000476336 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-211ENST00000476336 HLA-DOAP06340 250 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-211ENST00000476336 PDE6AP16499 860 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-211ENST00000476336 PPIL2Q13356 520 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-211ENST00000476336 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-211ENST00000476336 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
PRAME-211ENST00000476336 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
PRAME-211ENST00000476336 TBC1D2Q9BYX2 928 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-211ENST00000476336 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP16.14■□□□□ 0.17
PRAME-211ENST00000476336 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
PRAME-211ENST00000476336 PICK1Q9NRD5 415 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-211ENST00000476336 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-211ENST00000476336 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-211ENST00000476336 FLT1P17948 1338 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-211ENST00000476336 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
PRAME-211ENST00000476336 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PRAME-211ENST00000476336 CETPP11597 493 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-211ENST00000476336 USP5P45974 858 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-211ENST00000476336 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
PRAME-211ENST00000476336 SNAPC2Q13487 334 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-211ENST00000476336 UBE3CQ15386 1083 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-211ENST00000476336 IFNL1Q8IU54 200 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-211ENST00000476336 SCYL3Q8IZE3 742 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-211ENST00000476336 OTUD5Q96G74 571 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-211ENST00000476336 TRIM34Q9BYJ4 488 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-211ENST00000476336 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
PRAME-211ENST00000476336 GINM1Q9NU53 330 aa16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms