RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 IDI2Q9BXS1 227 aa10.62□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 HELLSQ9NRZ9 838 aa10.62□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa10.62□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 FLT1P17948 1338 aa10.61□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 ENTPD3O75355 529 aa10.61□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 CHMLP26374 656 aa10.61□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa10.61□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa10.61□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 TEPSINQ96N21 525 aa10.61□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa10.61□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 CELF2O95319 508 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 APPP05067 770 aa10.6□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 PRKG1Q13976 671 aa10.6□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa10.6□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 PALD1Q9ULE6 856 aa10.6□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 PASKQ96RG2 1323 aa10.59□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 NPM3O75607 178 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 GNAT2P19087 354 aa10.59□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 NF2P35240 595 aa10.59□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa10.59□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 RUFY2Q8WXA3 655 aa10.59□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 DDRGK1Q96HY6 314 aa10.59□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 CSRNP1Q96S65 589 aa10.59□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 IL25Q9H293 177 aa10.59□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa10.59□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 MCM9Q9NXL9 1143 aa10.59□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 FZD1Q9UP38 647 aa10.59□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa10.59□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC171Q6TFL3 1326 aa10.58□□□□□ -0.71
CASQ1-202ENST00000467691 FOCADQ5VW36 1801 aa10.58□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 SSC5DA1L4H1 1573 aa10.58□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 GSG1L2A8MUP6 293 aa10.58□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 CDC45O75419 566 aa10.58□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 SLURP2P0DP57 97 aa10.58□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 TDO2P48775 406 aa10.58□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 VPS53Q5VIR6 699 aa10.58□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 CST9Q5W186 159 aa10.58□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 CASC1Q6TDU7 716 aa10.58□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 MIGA2Q7L4E1 593 aa10.58□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 NAV1Q8NEY1 1877 aa10.57□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 ATRNL1Q5VV63 1379 aa10.57□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa10.57□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 HLA-DOAP06340 250 aa10.57□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 CYP2D6P10635 497 aa10.57□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 C1QTNF8P60827 252 aa10.57□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 EVX2Q03828 476 aa10.57□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 MOB2Q70IA6 237 aa10.57□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 IFNL3Q8IZI9 196 aa10.57□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 HOOK2Q96ED9 719 aa10.57□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 NACAP1Q9BZK3 213 aa10.57□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 RAD50Q92878 1312 aa10.57□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM88BA6NKF7 163 aa10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 FAM196BA6NMK8 535 aa10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 MINDY4BA8MYZ0 360 aa10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 USP17L12C9JPN9 530 aa10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 USP17L21D6R901 530 aa10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 FOXP2O15409 715 aa10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 SGSM2O43147 1006 aa10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 PLCD1P51178 756 aa10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 APLP1P51693 650 aa10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 DCAF15Q66K64 600 aa10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 GIMAP6Q6P9H5 292 aa10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 CTR9Q6PD62 1173 aa10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 TTC6Q86TZ1 520 aa10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 AMOTL1Q8IY63 956 aa10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 C2orf69Q8N8R5 385 aa10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 TRIM34Q9BYJ4 488 aa10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 NAPBQ9H115 298 aa10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 PI4KBQ9UBF8 816 aa10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 MYH1P12882 1939 aa10.55□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 UBE2Q2LH0YL09 131 aa10.55□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 SMIM22K7EJ46 135 aa10.55□□□□□ -0.72
CASQ1-202ENST00000467691 USP2O75604 605 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms