RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 ATP5JP18859 108 aa17.94■□□□□ 0.46
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SH3BP1-205ENST00000466097 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP17.94■□□□□ 0.46
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SH3BP1-205ENST00000466097 WNK4Q96J92 1243 aa17.94■□□□□ 0.46
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SH3BP1-205ENST00000466097 CSRNP1Q96S65 589 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1-205ENST00000466097 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP17.94■□□□□ 0.46
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SH3BP1-205ENST00000466097 PHF20L1A8MW92 1017 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC34A2O95436 690 aa17.84■□□□□ 0.45
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SH3BP1-205ENST00000466097 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
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SH3BP1-205ENST00000466097 MYH8P13535 1937 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa17.83■□□□□ 0.44
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