RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KDR	P35968	1356 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIAA0754	O94854	1291 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HMOX1	P09601	288 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ICA1	Q05084	483 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FSIP1	Q8NA03	581 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM232	C9JQI7	657 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RASSF9	O75901	435 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CLSTN1	O94985	981 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AMPH	P49418	695 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SMTN	P53814	917 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRAF1	Q13077	416 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STK3	Q13188	491 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	VSTM4	Q8IW00	320 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GRIN2D	O15399	1336 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RAB11FIP3	O75154	756 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PEX19	P40855	299 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TUBB4B	P68371	445 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CFAP100	Q494V2	611 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARMC3	Q5W041	872 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	JAK2	O60674	1132 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SERPINC1	P01008	464 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GNAI2	P04899	355 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDE6B	P35913	854 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GNGT1	P63211	74 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPFIA1	Q13136	1202 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PSMD2	Q13200	908 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BRF1	Q92994	677 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FANCL	Q9NW38	375 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM83G	A6ND36	823 aa		11.9	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		11.9	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AGPS	O00116	658 aa		11.9	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TUBB	P07437	444 aa		11.9	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		11.9	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDHB	P11177	359 aa		11.9	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RPS6KA3	P51812	740 aa		11.9	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		11.9	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		11.9	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPDL1	Q96EA4	605 aa		11.9	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		11.9	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		11.9	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		11.9	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658		F6X3S4	739 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STX10	O60499	249 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MTX1	Q13505	466 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STIM1	Q13586	685 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	WDR93	Q6P2C0	686 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM228A	Q86W67	206 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDILT	Q8N807	584 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NRAP	Q86VF7	1730 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AOX1	Q06278	1338 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658		A0A0U1RQJ8	604 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658		H3BQV1	296 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CTAGE8	P0CG41	777 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DCTN1	Q14203	1278 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IFFO2	Q5TF58	517 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ENO4	A6NNW6	628 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NDUFAB1	O14561	156 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARHGAP25	P42331	645 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ME1	P48163	572 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	E2F5	Q15329	346 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658		A0A1B0GVL5	298 aa		11.88	□□□□□ -0.51

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