RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 CYP26A1O43174 497 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 LEFTY1O75610 366 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 FOSL1P15407 271 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 GNA15P30679 374 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 CDK8P49336 464 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 MAP3K11Q16584 847 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 PPM1JQ5JR12 505 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 PCNX4Q63HM2 1172 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 C12orf40Q86WS4 652 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 NPAS4Q8IUM7 802 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 FAM181AQ8N9Y4 354 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 GIMAP7Q8NHV1 300 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 ISL2Q96A47 359 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 BCL2L13Q9BXK5 485 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 CEP44Q9C0F1 390 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 ATXN3LQ9H3M9 355 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 FAM8A1Q9UBU6 413 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 PPM1HQ9ULR3 514 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 U3KQE9 123 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 GIPC1O14908 333 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 FAM87AP0C7U9 286 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 GP2P55259 537 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 MSMPQ1L6U9 139 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 MEI1Q5TIA1 1274 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 LLGL2Q6P1M3 1020 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 DTX1Q86Y01 620 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 PARP2Q9UGN5 583 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 PCDHA4Q9UN74 947 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 F6X3S4 739 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 RBM25P49756 843 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 INPP5AQ14642 412 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 DUSP27Q5VZP5 1158 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 BCL11AQ9H165 835 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 PICK1Q9NRD5 415 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 TRIM37O94972 964 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 WNT11O96014 354 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 NTF4P34130 210 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 ERVK-24P63145 666 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 SEPT6Q14141 434 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 TTBK2Q6IQ55 1244 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 LRFN4Q6PJG9 635 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 OGFOD3Q6PK18 319 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 NFXL1Q6ZNB6 911 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 TOP6BLQ8N6T0 577 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 RNF214Q8ND24 703 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 GIPC2Q8TF65 315 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 GAL3ST3Q96A11 431 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 SAMM50Q9Y512 469 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 AK5Q9Y6K8 562 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 CYP27A1Q02318 531 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 PSMD2Q13200 908 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 LRRC14Q15048 493 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 ZBTB37Q5TC79 503 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 SV2BQ7L1I2 683 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 FBXO33Q7Z6M2 555 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 ABI1Q8IZP0 508 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF428Q96B54 188 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 ELMO3Q96BJ8 720 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 PLPPR2Q96GM1 343 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 DUSP23Q9BVJ7 150 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 CCDC39Q9UFE4 941 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 CTSHP09668 335 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 ITIH2P19823 946 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 CD96P40200 585 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 BNIP3Q12983 259 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 COL19A1Q14993 1142 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 FLCNQ8NFG4 579 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 FBRSQ9HAH7 460 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 CYP8B1Q9UNU6 501 aa4.1□□□□□ -1.75
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