RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412845.1

NEFHP1-201, Transcript of neurofilament heavy pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene NEFHP1, Length 2,629 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP1-201ENST00000412845 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
NEFHP1-201ENST00000412845 DESI2Q9BSY9 194 aa21.58■■□□□ 1.05
NEFHP1-201ENST00000412845 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.05
NEFHP1-201ENST00000412845 INCENPQ9NQS7 918 aa21.58■■□□□ 1.05
NEFHP1-201ENST00000412845 MRFAP1Q9Y605 127 aa21.58■■□□□ 1.05
NEFHP1-201ENST00000412845 CUTAO60888 179 aa21.58■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 PPP2R3AQ06190 1150 aa21.58■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 NTRK3Q16288 839 aa21.58■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.58■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 PRR29P0C7W0 189 aa21.57■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 KIFC2Q96AC6 838 aa21.57■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 TRERF1Q96PN7 1200 aa21.57■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.57■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 MCAMP43121 646 aa21.57■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.57■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa21.57■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.57■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 OAS2P29728 719 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.56■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.56■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 CDKL5O76039 1030 aa21.56■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 TPM1P09493 284 aa21.56■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 KARSQ15046 597 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa21.56■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 MED15Q96RN5 788 aa21.56■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 STX10O60499 249 aa21.55■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF18P17022 549 aa21.55■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 MTF1Q14872 753 aa21.55■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 SMARCE1Q969G3 411 aa21.55■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 DHX58Q96C10 678 aa21.55■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 PARD6BQ9BYG5 372 aa21.55■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 COL18A1P39060 1754 aa21.55■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 MYO1BO43795 1136 aa21.55■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 APPP05067 770 aa21.55■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa21.55■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 CAPN2P17655 700 aa21.54■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa21.54■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.54■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 ALS2Q96Q42 1657 aa21.54■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.54■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 ZBTB43O43298 467 aa21.54■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 ADD2P35612 726 aa21.54■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 RGS22Q8NE09 1264 aa21.54■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 FAM89AQ96GI7 184 aa21.54■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.54■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 ATP8B1O43520 1251 aa21.53■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 GUCY1A2P33402 732 aa21.53■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 TRIM29Q14134 588 aa21.53■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 POSTNQ15063 836 aa21.53■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.53■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 SERTAD1Q9UHV2 236 aa21.53■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.53■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 BTBD18B2RXH4 712 aa21.53■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 LY9Q9HBG7 655 aa21.53■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.53■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 A0A0U1RQJ8 604 aa21.52■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 TULP2O00295 520 aa21.52■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.52■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 ATRIPQ8WXE1 791 aa21.52■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa21.52■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa21.52■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 GYS2P54840 703 aa21.52■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 SYNE4Q8N205 404 aa21.52■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 FUT8Q9BYC5 575 aa21.52■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
NEFHP1-201ENST00000412845 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.51■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.51■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 ARFGAP3Q9NP61 516 aa21.51■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 KCNJ14Q9UNX9 436 aa21.51■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 SOWAHDA6NJG2 315 aa21.51■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 IDH1O75874 414 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.51■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 SARSP49591 514 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.5■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 RABGGTAQ92696 567 aa21.5■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 RAI14Q9P0K7 980 aa21.5■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.5■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 MORC3Q14149 939 aa21.5■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms