RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409300.5

RAD9B-204, Transcript of RAD9 checkpoint clamp component B, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD9B, Length 2,732 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD9B-204	ENST00000409300	PSMD1	Q99460	953 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	SCN9A	Q15858	1988 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	DACT2	Q5SW24	774 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	TEX11	Q8IYF3	940 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	RAD17	O75943	681 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	13.27	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	NFKBIB	Q15653	356 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	KRT23	Q9C075	422 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	SOGA3	Q5TF21	947 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	PPFIA3	O75145	1194 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	PICALM	Q13492	652 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	TEKT1	Q969V4	418 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	GAK	O14976	1311 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	PLCG2	P16885	1265 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	RHBDL3	P58872	404 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	GJB2	P29033	226 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	SCRN1	Q12765	414 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	ILDR2	Q71H61	639 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	GTF3C6	Q969F1	213 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	SENP2	Q9HC62	589 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	SPON1	Q9HCB6	807 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	CRK	P46108	304 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	PLCD1	P51178	756 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	NUCB2	P80303	420 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	CERS3	Q8IU89	383 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	ESR2	Q92731	530 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	USP40	Q9NVE5	1235 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	FLT1	P17948	1338 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	RXRA	P19793	462 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	NIM1K	Q8IY84	436 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	PSMD14	O00487	310 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	SBK1	Q52WX2	424 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	C12orf60	Q5U649	245 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	FBXL16	Q8N461	479 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	DDX11	Q96FC9	970 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	TMEM87B	Q96K49	555 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	COL4A5	P29400	1685 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	JAK2	O60674	1132 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	PFKFB2	O60825	505 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	CACNB3	P54284	484 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	PDE4B	Q07343	736 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	ERICH2	A1L162	156 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	NFKBIE	O00221	500 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	JDP2	Q8WYK2	163 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	MYL10	Q9BUA6	226 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	LY9	Q9HBG7	655 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RAD9B-204	ENST00000409300	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29

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