RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 SPDYE5A6NIY4 337 aa24.73■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 RAB11FIP3O75154 756 aa24.73■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 ALDH1A1P00352 501 aa24.73■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 INPP5BP32019 993 aa24.73■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa24.72■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa24.72■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 DGKZQ13574 1117 aa24.71■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 ERO1BQ86YB8 467 aa24.71■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 ABHD8Q96I13 439 aa24.71■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 MS4A4AQ96JQ5 239 aa24.71■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa24.71■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF112Q9UJU3 913 aa24.71■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 ATRNL1Q5VV63 1379 aa24.7■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 CFHR5Q9BXR6 569 aa24.7■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 MCOLN1Q9GZU1 580 aa24.7■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR25O00155 361 aa24.69■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 IGSF3O75054 1194 aa24.69■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 NPM3O75607 178 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 IDH1O75874 414 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 BAG3O95817 575 aa24.69■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 GTF2A2P52657 109 aa24.69■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.69■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 ADGRA1Q86SQ6 560 aa24.69■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 TEX11Q8IYF3 940 aa24.69■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 PTPN18Q99952 460 aa24.69■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa24.68■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 CCL15Q16663 113 aa24.68■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 BRI3BPQ8WY22 251 aa24.68■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 ANTXR1Q9H6X2 564 aa24.68■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa24.68■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 PLCG2P16885 1265 aa24.67■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 IRF6O14896 467 aa24.66■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 SLURP2P0DP57 97 aa24.66■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 CYP7A1P22680 504 aa24.66■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP4CP60510 307 aa24.66■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 PPIL2Q13356 520 aa24.66■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 PHF20L1A8MW92 1017 aa24.65■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 MAP3K10Q02779 954 aa24.65■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 PPATQ06203 517 aa24.65■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 MAGEB6Q8N7X4 407 aa24.65■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 FOCADQ5VW36 1801 aa24.65■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 MAP3K12Q12852 859 aa24.64■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 CRHR2Q13324 411 aa24.64■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 SNAPC2Q13487 334 aa24.64■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRCC1Q9C099 1032 aa24.64■■□□□ 1.54
ANKRD39-201ENST00000393537 FKTNO75072 461 aa24.63■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 CETPP11597 493 aa24.63■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP24.63■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa24.63■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 DOCK1Q14185 1865 aa24.63■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa24.62■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 SCYL3Q8IZE3 742 aa24.62■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.62■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM196BA6NMK8 535 aa24.61■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 TBC1D12O60347 775 aa24.61■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 MIGA1Q8NAN2 632 aa24.61■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 DCTPP1Q9H773 170 aa24.61■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP24.61■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 PICK1Q9NRD5 415 aa24.61■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 FLT1P17948 1338 aa24.61■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 GOLIM4O00461 696 aa24.6■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.6■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 SIPA1L1O43166 1804 aa24.59■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 BTBD19C9JJ37 291 aa24.59■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 BOLA2Q9H3K6 86 aa24.59■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNH4Q9UQ05 1017 aa24.59■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC85CA6NKD9 419 aa24.58■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 PTPRAP18433 802 aa24.58■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 ATP5JP18859 108 aa24.58■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 CERS3Q8IU89 383 aa24.58■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 CRBNQ96SW2 442 aa24.58■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa24.58■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 ZHX2Q9Y6X8 837 aa24.58■■□□□ 1.53
ANKRD39-201ENST00000393537 MYH1P12882 1939 aa24.57■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 ATAD5Q96QE3 1844 aa24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms