RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372906.2

TTPAL-203, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TTPAL, Length 1,139 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-203ENST00000372906 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
TTPAL-203ENST00000372906 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa16.73■□□□□ 0.27
TTPAL-203ENST00000372906 DOCK2Q92608 1830 aa16.73■□□□□ 0.27
TTPAL-203ENST00000372906 PTPRFP10586 1907 aa16.72■□□□□ 0.27
TTPAL-203ENST00000372906 ADCY3O60266 1144 aa16.72■□□□□ 0.27
TTPAL-203ENST00000372906 ELNP15502 786 aa16.72■□□□□ 0.27
TTPAL-203ENST00000372906 FLT3LGP49771 235 aa16.72■□□□□ 0.27
TTPAL-203ENST00000372906 GADL1Q6ZQY3 521 aa16.72■□□□□ 0.27
TTPAL-203ENST00000372906 SCYL3Q8IZE3 742 aa16.72■□□□□ 0.27
TTPAL-203ENST00000372906 PRO3102Q9H379 93 aa16.72■□□□□ 0.27
TTPAL-203ENST00000372906 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
TTPAL-203ENST00000372906 PHIPQ8WWQ0 1821 aa16.72■□□□□ 0.27
TTPAL-203ENST00000372906 SALL1Q9NSC2 1324 aa16.71■□□□□ 0.27
TTPAL-203ENST00000372906 UBXN2AP68543 259 aa16.71■□□□□ 0.27
TTPAL-203ENST00000372906 IDI2Q9BXS1 227 aa16.71■□□□□ 0.27
TTPAL-203ENST00000372906 PICK1Q9NRD5 415 aa16.71■□□□□ 0.27
TTPAL-203ENST00000372906 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
TTPAL-203ENST00000372906 DENND2AQ9ULE3 1009 aa16.71■□□□□ 0.27
TTPAL-203ENST00000372906 ENTPD3O75355 529 aa16.7■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 CIAO1O76071 339 aa16.7■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 SGPL1O95470 568 aa16.7■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 TIMM10P62072 90 aa16.7■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 MAP3K10Q02779 954 aa16.7■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 CCDC102BQ68D86 513 aa16.7■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 SLAIN1Q8ND83 568 aa16.7■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 HTATIP2Q9BUP3 242 aa16.7■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 GAKO14976 1311 aa16.7■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 RFX7Q2KHR2 1363 aa16.69■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 TRIM75PA6NK02 468 aa16.69■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 INHAP05111 366 aa16.69■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 CDCA7LQ96GN5 454 aa16.69■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 COL6A3P12111 3177 aa16.68■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 DOCK1Q14185 1865 aa16.68■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 FAM196BA6NMK8 535 aa16.68■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 SLFN5Q08AF3 891 aa16.68■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 PICALMQ13492 652 aa16.68■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 RASGRF1Q13972 1273 aa16.68■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa16.68■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 DEFB118Q96PH6 123 aa16.68■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 ABCF2Q9UG63 623 aa16.68■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 FBXO3Q9UK99 471 aa16.68■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 E9PSI1 815 aa16.67■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 SEMA3EO15041 775 aa16.67■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 TFRCP02786 760 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 IL15P40933 162 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 BTDP43251 543 aa16.67■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 TREML2Q5T2D2 321 aa16.67■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF384Q8TF68 577 aa16.67■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 SMC4Q9NTJ3 1288 aa16.67■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 TAOK2Q9UL54 1235 aa16.67■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 NR2E3Q9Y5X4 410 aa16.67■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 ALPK3Q96L96 1907 aa16.66■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 ALDH1L2Q3SY69 923 aa16.66■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa16.66■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 LAMA3Q16787 3333 aa16.66■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 EVI5O60447 810 aa16.65■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 RHBDL3P58872 404 aa16.65■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 MECOMQ03112 1051 aa16.65■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 IRF5Q13568 498 aa16.65■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 PXYLP1Q8TE99 480 aa16.65■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 COPRSQ9NQ92 184 aa16.65■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 STAP2Q9UGK3 403 aa16.65■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa16.65■□□□□ 0.26
TTPAL-203ENST00000372906 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
TTPAL-203ENST00000372906 XAGE2Q96GT9 111 aa16.64■□□□□ 0.25
TTPAL-203ENST00000372906 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
TTPAL-203ENST00000372906 MEIS3Q99687 375 aa16.64■□□□□ 0.25
TTPAL-203ENST00000372906 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa16.64■□□□□ 0.25
TTPAL-203ENST00000372906 A0A0C4DFX4 3053 aa16.63■□□□□ 0.25
TTPAL-203ENST00000372906 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa16.63■□□□□ 0.25
TTPAL-203ENST00000372906 A0A1B0GUL7 405 aa16.63■□□□□ 0.25
TTPAL-203ENST00000372906 ZBTB22O15209 634 aa16.63■□□□□ 0.25
TTPAL-203ENST00000372906 TFCP2Q12800 502 aa16.63■□□□□ 0.25
TTPAL-203ENST00000372906 SPP2Q13103 211 aa16.63■□□□□ 0.25
TTPAL-203ENST00000372906 PI16Q6UXB8 463 aa16.63■□□□□ 0.25
TTPAL-203ENST00000372906 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa16.63■□□□□ 0.25
TTPAL-203ENST00000372906 LRCH3Q96II8 777 aa16.63■□□□□ 0.25
TTPAL-203ENST00000372906 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa16.63■□□□□ 0.25
TTPAL-203ENST00000372906 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP16.63■□□□□ 0.25
TTPAL-203ENST00000372906 TRIM32Q13049 653 aa16.62■□□□□ 0.25
TTPAL-203ENST00000372906 ERICH6Q7L0X2 663 aa16.62■□□□□ 0.25
TTPAL-203ENST00000372906 SLF2Q8IX21 1173 aa16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms