RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 PREPP48147 710 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 RACK1P63244 317 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 USP48Q86UV5 1035 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 TMPRSS2O15393 492 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 ID3Q02535 119 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 INPP5AQ14642 412 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 FBXL19Q6PCT2 694 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM221AA4D161 298 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 GREM1O60565 184 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 F13A1P00488 732 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 CDK8P49336 464 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 DYMQ7RTS9 669 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 DISC1Q9NRI5 854 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 CSADQ9Y600 493 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-202ENST00000370826 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 ERVK-24P63145 666 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 RING1Q06587 406 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 UVSSAQ2YD98 709 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 C12orf40Q86WS4 652 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF654Q8IZM8 581 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 TP53INP1Q96A56 240 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 MYRFLQ96LU7 910 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 ATXN3LQ9H3M9 355 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 GFRA2O00451 464 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 CILPO75339 1184 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 BMP3P12645 472 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 ASPAP45381 313 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 USP11P51784 963 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM196AQ6ZSG2 479 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 HDXQ7Z353 690 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 SPON2Q9BUD6 331 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 DHX15O43143 795 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 DYRK3O43781 588 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 SGO2Q562F6 1265 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 PPM1JQ5JR12 505 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 KIAA0825Q8IV33 1275 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 FBXO27Q8NI29 283 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 ZFP64Q9NPA5 681 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 ROBO2Q9HCK4 1378 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 MPP2Q14168 576 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 TTLL4Q14679 1199 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 NBPF11Q86T75 865 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF214Q8ND24 703 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 UBP1Q9NZI7 540 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-202ENST00000370826 FANCGO15287 622 aa6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms