RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 IVLP07476 585 aa22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA5Q8NB90 893 aa22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC50Q8IVM0 306 aa22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 TTC14Q96N46 770 aa22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 SP4Q02446 784 aa22.74■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 ZAP70P43403 619 aa22.74■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.74■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa22.74■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.74■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.74■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 KRT40Q6A162 431 aa22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 RBSNQ9H1K0 784 aa22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 CETN3O15182 167 aa22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 VPS16Q9H269 839 aa22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 ATP7AQ04656 1500 aa22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 TCIRG1Q13488 830 aa22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 TXKP42681 527 aa22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 SSH3Q8TE77 659 aa22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 PPM1EQ8WY54 764 aa22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 SMTNP53814 917 aa22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF202O95125 648 aa22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 CALCOCO2Q13137 446 aa22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 FNBP1Q96RU3 617 aa22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 DPH6Q7L8W6 267 aa22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 SLC1A4P43007 532 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 RHOXF2BP0C7M4 288 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF354CQ86Y25 554 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 RHOXF2Q9BQY4 288 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 USP44Q9H0E7 712 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 STK24Q9Y6E0 443 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 FANCCQ00597 558 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 BIRC3Q13489 604 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.7■■□□□ 1.23
CCSAP-203ENST00000366687 ABCC4O15439 1325 aa22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 IFT81Q8WYA0 676 aa22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 ATP2C2O75185 946 aa22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 WDR44Q5JSH3 913 aa22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 PHKBQ93100 1093 aa22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 PAK1Q13153 545 aa22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 STK32BQ9NY57 414 aa22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 CAPN2P17655 700 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF445P59923 1031 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 CEP63Q96MT8 703 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 PSMD1Q99460 953 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 MYL10Q9BUA6 226 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 E7EWF7 191 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 KIFAP3Q92845 792 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 PICK1Q9NRD5 415 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 RSPH14Q9UHP6 348 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 ADCY7P51828 1080 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 ANKS4BQ8N8V4 417 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 TIGD1Q96MW7 591 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 MAP3K9P80192 1104 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 NUP58Q9BVL2 599 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 TUBB2AQ13885 445 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 CFAP58Q5T655 872 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 DISP1Q96F81 1524 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 TUBB2BQ9BVA1 445 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 TLDC2A0PJX2 215 aa22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms