RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 ERICH2A1L162 156 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 FAM177BA6PVY3 158 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 SMTNL1A8MU46 457 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 RXRAP19793 462 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 BCAMP50895 628 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 LRRC8AQ8IWT6 810 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 AIFM3Q96NN9 605 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 SENP2Q9HC62 589 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.63■■□□□ 1.21
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SPNS1-201ENST00000311008 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.62■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.62■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.62■■□□□ 1.21
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SPNS1-201ENST00000311008 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 SYKP43405 635 aa22.62■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 GSDMDP57764 484 aa22.62■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 PTPAQ15257 358 aa22.62■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.62■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.62■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 HPSEQ9Y251 543 aa22.62■■□□□ 1.21
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SPNS1-201ENST00000311008 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 LCORLQ8N3X6 602 aa22.61■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 MAP3K14Q99558 947 aa22.61■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.61■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 CHD4Q14839 1912 aa22.61■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 CUTAO60888 179 aa22.61■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 ITPK1Q13572 414 aa22.61■■□□□ 1.21
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SPNS1-201ENST00000311008 A0A0G2JS52 829 aa22.6■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 SNAP23O00161 211 aa22.6■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 PPP2R5BQ15173 497 aa22.6■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 DPCR1Q3MIW9 517 aa22.6■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.6■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 RTN1Q16799 776 aa22.59■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.59■■□□□ 1.21
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SPNS1-201ENST00000311008 BCORQ6W2J9 1755 aa22.59■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 NRAPQ86VF7 1730 aa22.58■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 IKBKBO14920 756 aa22.58■■□□□ 1.21
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SPNS1-201ENST00000311008 PRKAB2O43741 272 aa22.58■■□□□ 1.21
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SPNS1-201ENST00000311008 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
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SPNS1-201ENST00000311008 TOMM22Q9NS69 142 aa22.58■■□□□ 1.2
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SPNS1-201ENST00000311008 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.58■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 A0A087WWV3 80 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 DEXIO95424 95 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 MMP1P03956 469 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 CYP7A1P22680 504 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 SHC4Q6S5L8 630 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 PPARAQ07869 468 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 SKILP12757 684 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 ESR2Q92731 530 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 KCND1Q9NSA2 647 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
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SPNS1-201ENST00000311008 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 MYO1BO43795 1136 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 ADAMTS2O95450 1211 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 TNNT1P13805 278 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 FBXW7Q969H0 707 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 FANCBQ8NB91 859 aa22.54■■□□□ 1.2
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