RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 EPHA10Q5JZY3 1008 aa16.71■□□□□ 0.27
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CCNDBP1-201ENST00000300213 TRIM10Q9UDY6 481 aa16.71■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 A1BGP04217 495 aa16.71■□□□□ 0.27
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CCNDBP1-201ENST00000300213 C19orf44Q9H6X5 657 aa16.71■□□□□ 0.27
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CCNDBP1-201ENST00000300213 KRT40Q6A162 431 aa16.69■□□□□ 0.26
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CCNDBP1-201ENST00000300213 SCLT1Q96NL6 688 aa16.68■□□□□ 0.26
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CCNDBP1-201ENST00000300213 COL15A1P39059 1388 aa16.66■□□□□ 0.26
CCNDBP1-201ENST00000300213 MED23Q9ULK4 1368 aa16.66■□□□□ 0.26
CCNDBP1-201ENST00000300213 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
CCNDBP1-201ENST00000300213 GRIN1Q05586 938 aa16.66■□□□□ 0.26
CCNDBP1-201ENST00000300213 PDCLQ13371 301 aa16.66■□□□□ 0.26
CCNDBP1-201ENST00000300213 FLT4P35916 1363 aa16.66■□□□□ 0.26
CCNDBP1-201ENST00000300213 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
CCNDBP1-201ENST00000300213 TICAM2Q86XR7 235 aa16.66■□□□□ 0.26
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
CCNDBP1-201ENST00000300213 CD248Q9HCU0 757 aa16.66■□□□□ 0.26
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CCNDBP1-201ENST00000300213 NF2P35240 595 aa16.65■□□□□ 0.26
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