RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 USP17L21D6R901 530 aa24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 SBF1O95248 1867 aa24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 FZD9O00144 591 aa24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 SBK1Q52WX2 424 aa24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 AMOTL1Q8IY63 956 aa24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 FLT1P17948 1338 aa24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 UTRNP46939 3433 aa24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 AK2P54819 239 aa24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 STAG1Q8WVM7 1258 aa24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 CNNM2Q9H8M5 875 aa24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 USP40Q9NVE5 1235 aa24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 MYH1P12882 1939 aa24.53■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 USP17L8P0C7I0 530 aa24.53■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 CFAP100Q494V2 611 aa24.53■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.53■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa24.52■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKRD1Q15327 319 aa24.52■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 NEDD4P46934 1319 aa24.52■■□□□ 1.52
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 PCP11498 1178 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 RPS12P25398 132 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 KRT23Q9C075 422 aa24.51■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa24.51■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 MCM5P33992 734 aa24.51■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 MMP14P50281 582 aa24.5■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 FGD1P98174 961 aa24.5■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 C12orf60Q5U649 245 aa24.5■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa24.5■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 WDR19Q8NEZ3 1342 aa24.5■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 B4E1Z4 1266 aa24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 PICALMQ13492 652 aa24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 TMX3Q96JJ7 454 aa24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 TOMM22Q9NS69 142 aa24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 ROBO3Q96MS0 1386 aa24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP2D6P10635 497 aa24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 DLGAP5Q15398 846 aa24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 Q6ZUG5 572 aa24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 STK11IPQ8N1F8 1099 aa24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 SPDYE2BA6NHP3 402 aa24.48■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 SPDYE6P0CI01 402 aa24.48■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 INCENPQ9NQS7 918 aa24.48■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 TACC3Q9Y6A5 838 aa24.48■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 GJA3Q9Y6H8 435 aa24.48■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF541Q9H0D2 1346 aa24.48■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 SMIM22K7EJ46 135 aa24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 PRC1O43663 620 aa24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 CHST3Q7LGC8 479 aa24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 FGRP09769 529 aa24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 PDE4BQ07343 736 aa24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 MTMR14Q8NCE2 650 aa24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 DPF2Q92785 391 aa24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 IDI2Q9BXS1 227 aa24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRC2Q9BYS8 371 aa24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 KDM4AO75164 1064 aa24.46■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 ANTXR2P58335 489 aa24.46■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 EVX2Q03828 476 aa24.46■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 FBXL16Q8N461 479 aa24.46■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 ESR2Q92731 530 aa24.46■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
PACSIN3-201ENST00000298838 NPM3O75607 178 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
PACSIN3-201ENST00000298838 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
PACSIN3-201ENST00000298838 NFIAQ12857 509 aa24.45■■□□□ 1.5
PACSIN3-201ENST00000298838 GPR162Q16538 588 aa24.45■■□□□ 1.5
PACSIN3-201ENST00000298838 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
PACSIN3-201ENST00000298838 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
PACSIN3-201ENST00000298838 AGXT2Q9BYV1 514 aa24.45■■□□□ 1.5
PACSIN3-201ENST00000298838 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
PACSIN3-201ENST00000298838 TMOD2Q9NZR1 351 aa24.45■■□□□ 1.5
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF181Q9P0P0 153 aa24.45■■□□□ 1.5
PACSIN3-201ENST00000298838 PLCD1P51178 756 aa24.45■■□□□ 1.5
PACSIN3-201ENST00000298838 CYB5R4Q7L1T6 521 aa24.45■■□□□ 1.5
PACSIN3-201ENST00000298838 TTC6Q86TZ1 520 aa24.45■■□□□ 1.5
PACSIN3-201ENST00000298838 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa24.45■■□□□ 1.5
PACSIN3-201ENST00000298838 BRF1Q92994 677 aa24.45■■□□□ 1.5
PACSIN3-201ENST00000298838 MYOZ2Q9NPC6 264 aa24.45■■□□□ 1.5
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