RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293308.11

KRT8-201, Transcript of keratin 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene KRT8, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT8-201ENST00000293308 SUSD4Q5VX71 490 aa20.13■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.13■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.13■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 NEDD4P46934 1319 aa20.13■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 CDKL5O76039 1030 aa20.13■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 SERPINB2P05120 415 aa20.13■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 ZAP70P43403 619 aa20.13■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 CCZ1BP86790 482 aa20.13■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.13■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.13■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 CNBD1Q8NA66 436 aa20.13■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 CCDC112Q8NEF3 446 aa20.13■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 FEZ1Q99689 392 aa20.13■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 CLIC4Q9Y696 253 aa20.13■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 ZMYM6O95789 1325 aa20.13■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 AKAP11Q9UKA4 1901 aa20.12■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 SKILP12757 684 aa20.12■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 ADD2P35612 726 aa20.12■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 UBE3CQ15386 1083 aa20.12■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 ANO1Q5XXA6 986 aa20.12■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 CEP135Q66GS9 1140 aa20.12■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 AOPEPQ8N6M6 819 aa20.12■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa20.11■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 A0A1B0GVL5 298 aa20.11■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 CCDC69A6NI79 296 aa20.11■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 NLRP12P59046 1061 aa20.11■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 TPM4P67936 248 aa20.11■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 TRDNQ13061 729 aa20.11■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 SCARF1Q14162 830 aa20.11■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 ATP2B3Q16720 1220 aa20.11■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.11■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 SPON1Q9HCB6 807 aa20.11■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 PPP6R2O75170 966 aa20.11■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 NTSR2O95665 410 aa20.11■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 TUBB4AP04350 444 aa20.11■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 HAND2P61296 217 aa20.11■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 SLC39A14Q15043 492 aa20.11■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 IKBKBO14920 756 aa20.1■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 ZNF202O95125 648 aa20.1■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 ST5P78524 1137 aa20.1■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 CCDC150Q8NCX0 1101 aa20.1■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 FAM89AQ96GI7 184 aa20.1■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 PTPN14Q15678 1187 aa20.09■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 ALX1Q15699 326 aa20.09■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 JMYQ8N9B5 988 aa20.09■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 TMEM87BQ96K49 555 aa20.09■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 MYO1BO43795 1136 aa20.09■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 MCAMP43121 646 aa20.08■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 METTL24Q5JXM2 366 aa20.08■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 PRR5LQ6MZQ0 368 aa20.08■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 NBPF11Q86T75 865 aa20.08■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.08■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
KRT8-201ENST00000293308 DPCR1Q3MIW9 517 aa20.07■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 ERFEQ4G0M1 354 aa20.07■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa20.07■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 CCDC24Q8N4L8 307 aa20.07■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.07■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 TUBE1Q9UJT0 475 aa20.07■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 HPSEQ9Y251 543 aa20.07■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 MYH3P11055 1940 aa20.07■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.07■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 KIF28PB7ZC32 967 aa20.07■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa20.07■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 PFKFB1P16118 471 aa20.07■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa20.07■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa20.07■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 NBPF3Q9H094 633 aa20.07■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 STK36Q9NRP7 1315 aa20.06■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 PTGER2P43116 358 aa20.06■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.82e-7■■□□□ 13.4
KRT8-201ENST00000293308 SGMS1Q86VZ5 419 aa20.06■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 NRXN2Q9P2S2 1712 aa20.06■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa20.06■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 NID2Q14112 1375 aa20.06■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 NRDCO43847 1150 aa20.05■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 ITGA6P23229 1130 aa20.05■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 CTSWP56202 376 aa20.05■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 ARID5BQ14865 1188 aa20.05■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 NCAPHQ15003 741 aa20.05■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa20.05■□□□□ 0.8
KRT8-201ENST00000293308 SYNE4Q8N205 404 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms