RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 STX1AQ16623 288 aa25.09■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 TNNI3KQ59H18 835 aa25.09■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 VPS53Q5VIR6 699 aa25.09■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 EVI5LQ96CN4 794 aa25.09■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.09■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 BECN2A8MW95 431 aa25.08■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 ELF1P32519 619 aa25.08■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 NEDD9Q14511 834 aa25.08■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 FAM71BQ8TC56 605 aa25.08■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.08■■□□□ 1.61
PITX1-201ENST00000265340 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 TXLNAP40222 546 aa25.07■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 ARMCX5Q6P1M9 558 aa25.07■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 CNNM3Q8NE01 707 aa25.07■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 FANCGO15287 622 aa25.07■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 MAP3K9P80192 1104 aa25.07■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.07■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 NR1I2O75469 434 aa25.06■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 GOLGA1Q92805 767 aa25.06■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa25.06■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 PPP2R3AQ06190 1150 aa25.06■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 DDR1Q08345 913 aa25.06■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 HLFQ16534 295 aa25.06■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 DDX11Q96FC9 970 aa25.05■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 GPTP24298 496 aa25.05■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 PTH1RQ03431 593 aa25.05■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 RASEFQ8IZ41 740 aa25.05■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 FAM227BQ96M60 508 aa25.05■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 DBNDD2Q9BQY9 259 aa25.05■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 INHBEP58166 350 aa25.04■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.04■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 FMNL3Q8IVF7 1028 aa25.04■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 SPATA32Q96LK8 384 aa25.04■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 MCM8Q9UJA3 840 aa25.04■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa25.04■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 USP5P45974 858 aa25.04■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 LIG3P49916 1009 aa25.04■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 POTEDQ86YR6 584 aa25.04■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 MRFAP1Q9Y605 127 aa25.04■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.03■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD33BA6NCL7 494 aa25.03■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 MCM6Q14566 821 aa25.03■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 SYNE4Q8N205 404 aa25.03■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 FAM89AQ96GI7 184 aa25.03■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 LRRC24Q50LG9 513 aa25.03■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 VEZTQ9HBM0 779 aa25.03■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 SNX14Q9Y5W7 946 aa25.03■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 CTAGE5O15320 804 aa25.02■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 SCRN1Q12765 414 aa25.02■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 FBXW10Q5XX13 1052 aa25.02■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 CCDC83Q8IWF9 413 aa25.02■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 TEX11Q8IYF3 940 aa25.02■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PITX1-201ENST00000265340 CRKLP46109 303 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 HSP90B2PQ58FF3 399 aa25.01■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.01■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 RUFY2Q8WXA3 655 aa25.01■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 ATP5JP18859 108 aa25.01■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 A0A0D9SFI3 127 aa25■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 POTEB2H3BUK9 544 aa25■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 NEBLO76041 1014 aa25■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 LARGE1O95461 756 aa25■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 ITFG2Q969R8 447 aa25■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 FSD1Q9BTV5 496 aa25■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 L1RE1Q9UN81 338 aa25■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 ERLIN1O75477 346 aa25■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 SMIM5Q71RC9 77 aa25■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 BICD2Q8TD16 824 aa25■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa25■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 RAB21Q9UL25 225 aa25■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 FCHSD1Q86WN1 690 aa24.99■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 ANO10Q9NW15 660 aa24.99■■□□□ 1.59
PITX1-201ENST00000265340 TMCO5BA8MYB1 307 aa24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms