RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227474.7

PUS3-201, Transcript of pseudouridylate synthase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PUS3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3-201ENST00000227474 TMOD3Q9NYL9 352 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 HMG20BQ9P0W2 317 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 LZTS1Q9Y250 596 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 MBD3O95983 291 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 PDGFRBP09619 1106 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 CPA1P15085 419 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 KCNA2P16389 499 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 ATP2B1P20020 1258 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 PSMA5P28066 241 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 CASQ1P31415 396 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 CCT2P78371 535 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 TCIRG1Q13488 830 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 FBXO33Q7Z6M2 555 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 PIGBQ92521 554 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 PLA2G12BQ9BX93 195 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 PDCL3Q9H2J4 239 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 LRP6O75581 1613 aa10.11□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 PALLDQ8WX93 1383 aa10.11□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 EYA2O00167 538 aa10.11□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 ABCB7O75027 752 aa10.11□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 LARGE1O95461 756 aa10.11□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 AMPD3Q01432 767 aa10.11□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 ST3GAL1Q11201 340 aa10.11□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 ODR4Q5SWX8 454 aa10.11□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 RNF20Q5VTR2 975 aa10.11□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 ZBTB3Q9H5J0 574 aa10.11□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 AS3MTQ9HBK9 375 aa10.11□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 RBP3P10745 1247 aa10.1□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 GNALP38405 381 aa10.1□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 WASHC5Q12768 1159 aa10.1□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 KIAA1958Q8N8K9 716 aa10.1□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 KBTBD3Q8NAB2 608 aa10.1□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP10.1□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 CHAMP1Q96JM3 812 aa10.1□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 IER2Q9BTL4 223 aa10.1□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 ZNF609O15014 1411 aa10.1□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 SH3TC1Q8TE82 1336 aa10.1□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 BCL9O00512 1426 aa10.1□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 FOSP01100 380 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 CSF1RP07333 972 aa10.1□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 SYT1P21579 422 aa10.1□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 RPS6KB1P23443 525 aa10.1□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 PAX7P23759 505 aa10.1□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 ME3Q16798 604 aa10.1□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 MFSD4BQ5TF39 518 aa10.1□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 DNAJC10Q8IXB1 793 aa10.1□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 TSC1Q92574 1164 aa10.1□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 NBPF3Q9H094 633 aa10.1□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 BTG4Q9NY30 223 aa10.1□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 ASAP1Q9ULH1 1129 aa10.1□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 ERICH4A6NGS2 130 aa10.09□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 STX6O43752 255 aa10.09□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 KCNJ4P48050 445 aa10.09□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 KRT32Q14532 448 aa10.09□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 ANKRD1Q15327 319 aa10.09□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa10.09□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 TMEM63CQ9P1W3 806 aa10.09□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 ODF2LQ9ULJ1 636 aa10.09□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 TPCN1Q9ULQ1 816 aa10.09□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 GJA3Q9Y6H8 435 aa10.09□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
PUS3-201ENST00000227474 CDHR2Q9BYE9 1310 aa10.08□□□□□ -0.8
PUS3-201ENST00000227474 PLCH1Q4KWH8 1693 aa10.08□□□□□ -0.8
PUS3-201ENST00000227474 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa10.08□□□□□ -0.8
PUS3-201ENST00000227474 TRIM64CA6NLI5 447 aa10.08□□□□□ -0.8
PUS3-201ENST00000227474 STARD3NLO95772 234 aa10.08□□□□□ -0.8
PUS3-201ENST00000227474 LRRC24Q50LG9 513 aa10.08□□□□□ -0.8
PUS3-201ENST00000227474 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa10.08□□□□□ -0.8
PUS3-201ENST00000227474 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
PUS3-201ENST00000227474 LMNTD2Q8IXW0 634 aa10.08□□□□□ -0.8
PUS3-201ENST00000227474 CHPFQ8IZ52 775 aa10.08□□□□□ -0.8
PUS3-201ENST00000227474 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa10.08□□□□□ -0.8
PUS3-201ENST00000227474 PAF1Q8N7H5 531 aa10.08□□□□□ -0.8
PUS3-201ENST00000227474 PPP1R9BQ96SB3 815 aa10.08□□□□□ -0.8
PUS3-201ENST00000227474 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
PUS3-201ENST00000227474 HELLSQ9NRZ9 838 aa10.08□□□□□ -0.8
PUS3-201ENST00000227474 TAF6LQ9Y6J9 622 aa10.08□□□□□ -0.8
PUS3-201ENST00000227474 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa10.08□□□□□ -0.8
PUS3-201ENST00000227474 F13A1P00488 732 aa10.07□□□□□ -0.8
PUS3-201ENST00000227474 GJB2P29033 226 aa10.07□□□□□ -0.8
PUS3-201ENST00000227474 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PUS3-201ENST00000227474 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PUS3-201ENST00000227474 ARMC3Q5W041 872 aa10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms