RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006777.10

RHBDD2-201, Transcript of rhomboid domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RHBDD2, Length 1,802 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2-201ENST00000006777 CHAMP1Q96JM3 812 aa25.14■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 LY9Q9HBG7 655 aa25.14■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 TCHHQ07283 1943 aa25.13■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 FGRP09769 529 aa25.13■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 MFSD14BQ5SR56 506 aa25.13■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.13■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 RIMBP2O15034 1052 aa25.12■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 GRIK5Q16478 980 aa25.12■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 TMTC2Q8N394 836 aa25.12■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 TMEM87AQ8NBN3 555 aa25.12■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa25.12■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 ERICH2A1L162 156 aa25.12■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 USP17L12C9JPN9 530 aa25.12■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 USP17L21D6R901 530 aa25.12■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 APOA5Q6Q788 366 aa25.12■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 NFXL1Q6ZNB6 911 aa25.12■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 H3BQV1 296 aa25.11■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 CPLX1O14810 134 aa25.11■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 DIXDC1Q155Q3 683 aa25.11■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 IFFO2Q5TF58 517 aa25.11■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 OLFM4Q6UX06 510 aa25.11■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.11■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 MBD3O95983 291 aa25.1■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.1■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 SLX4Q8IY92 1834 aa25.1■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 CCDC69A6NI79 296 aa25.09■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 ZBTB43O43298 467 aa25.09■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 PLCG2P16885 1265 aa25.09■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 NT5C2P49902 561 aa25.09■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa25.09■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 USP5P45974 858 aa25.09■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 GTF2IP78347 998 aa25.09■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 WTAPQ15007 396 aa25.09■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.09■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 UBAC1Q9BSL1 405 aa25.09■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa25.08■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 ORC4O43929 436 aa25.08■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 CDKL5O76039 1030 aa25.08■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 RCAN1P53805 252 aa25.08■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 SLC12A7Q9Y666 1083 aa25.08■■□□□ 1.61
RHBDD2-201ENST00000006777 NID2Q14112 1375 aa25.08■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 GAKO14976 1311 aa25.08■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 CHRNA5P30532 468 aa25.07■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 STK11IPQ8N1F8 1099 aa25.07■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 CNPY2Q9Y2B0 182 aa25.07■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.07■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 G3V3G9 751 aa25.07■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 NCLP19338 710 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 BTDP43251 543 aa25.07■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.07■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa25.07■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 USP48Q86UV5 1035 aa25.07■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 CCDC125Q86Z20 511 aa25.07■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 AMOTL1Q8IY63 956 aa25.07■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 RGS22Q8NE09 1264 aa25.07■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 SENP2Q9HC62 589 aa25.07■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 MCM9Q9NXL9 1143 aa25.07■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 NAV1Q8NEY1 1877 aa25.06■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 GOLGA8AA7E2F4 631 aa25.05■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 FDPSP14324 419 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 KRT85P78386 507 aa25.05■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 PDE4BQ07343 736 aa25.05■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 PODNQ7Z5L7 613 aa25.05■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 FERMT3Q86UX7 667 aa25.05■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 MICU3Q86XE3 530 aa25.05■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 GPT2Q8TD30 523 aa25.05■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 DLEC1Q9Y238 1755 aa25.05■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 IQCA1Q86XH1 822 aa25.05■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa25.05■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa25.04■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 SMIM22K7EJ46 135 aa25.04■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 RESTQ13127 1097 aa25.04■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 SEC23AQ15436 765 aa25.04■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 C12orf60Q5U649 245 aa25.04■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 C7orf43Q8WVR3 580 aa25.04■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa25.04■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 GDPD2Q9HCC8 539 aa25.04■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 TNKSO95271 1327 aa25.04■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 DOK7Q18PE1 504 aa25.03■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 ROBO3Q96MS0 1386 aa25.03■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa25.02■■□□□ 1.6
RHBDD2-201ENST00000006777 FBXW7Q969H0 707 aa25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms