RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rhbdl3P58873 404 aa20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Siah1aP61092 282 aa20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sec23aQ01405 765 aa20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Arhgef16Q3U5C8 713 aa20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tbc1d5Q80XQ2 815 aa20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rbbp6P97868 1790 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CltaO08585 235 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ttc12Q8BW49 704 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Arfgef1G3X9K3 1846 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Myh6Q02566 1938 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dapk3O54784 448 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tspyl4Q8VD63 406 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sh3bp5lQ99LH9 392 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bap1Q99PU7 728 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 DmtnQ9WV69 405 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Irs4Q9Z0Y7 1216 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Heg1E9Q7X6 1337 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 A0A1W2P7S8 802 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ankrd63A2ARS0 390 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cdc5lQ6A068 802 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kif1bpQ6ZPU9 617 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kiaa1524Q8BWY9 907 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Eif4enif1Q9EST3 983 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Stk39Q9Z1W9 556 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Myh15E9Q264 1925 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 MsnP26041 577 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 McamQ8R2Y2 648 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pla2g12bQ99P27 195 aa20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pde4bB1AWC9 736 aa20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Atp1b3P97370 278 aa20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmed8Q3UHI4 326 aa20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sept9Q80UG5 583 aa20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Smc2Q8CG48 1191 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cnpy2Q9QXT0 182 aa20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gja10Q9WUS4 505 aa20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trim30aP15533 496 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rbm15bQ6PHZ5 887 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ube2oQ6ZPJ3 1288 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Haus7Q8BKT8 364 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Eno4Q8C042 619 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccdc39Q9D5Y1 937 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Xpo4Q9ESJ0 1151 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nek3Q9R0A5 511 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kcnh3Q9WVJ0 1095 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Grin2dQ03391 1323 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Myh4Q5SX39 1939 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pnpla6Q3TRM4 1355 aa20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zscan20B2KFW1 1030 aa20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Anks1aP59672 1150 aa20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prpf4bQ61136 1007 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Calm1P0DP26 149 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Calm2P0DP27 149 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Calm3P0DP28 149 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 IntuQ059U7 942 aa20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc7a1Q09143 622 aa20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ehmt1Q5DW34 1296 aa20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CtifQ6PEE2 600 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rbm42Q91V81 474 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Krt23Q99PS0 422 aa20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccdc94Q9D6J3 314 aa20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ktn1Q61595 1327 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zscan29E9Q5B4 869 aa20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tnni2P13412 182 aa20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Casp1P29452 402 aa20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Il15P48346 162 aa20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc27a1Q60714 646 aa20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dock5B2RY04 1868 aa20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bin1O08539 588 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dnajc2P54103 621 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ppp1r21Q3TDD9 780 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PsdQ5DTT2 1024 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cyp7b1Q60991 507 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cep89Q9CZX2 791 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lgr5Q9Z1P4 907 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm13023A2A8N2 498 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ces1hD3Z298 562 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gas2l3Q3UWW6 683 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Clec16aQ80U30 1036 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Large1Q9Z1M7 756 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cyp3a25O09158 503 aa20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 SsbP32067 415 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmtc2Q56A06 836 aa20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam170aQ66LM6 333 aa20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr119Q7TRJ5 321 aa20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kcnj14Q8JZN3 434 aa20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prpf3Q922U1 683 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cep120Q7TSG1 988 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cfap69Q8BH53 942 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 HmcesQ8R1M0 353 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 MlphQ91V27 590 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CoblQ5NBX1 1337 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Atp8b5A3FIN4 1183 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rps8P62242 208 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Usp13Q5BKP2 858 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prl2c1Q5SVL9 228 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Abcf1Q6P542 837 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Glis3Q6XP49 780 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 MbipQ99LQ1 341 aa20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 83.9 ms