RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bola3Q8CEI1 110 aa13.73□□□□□ -0.21
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Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdkl5Q3UTQ8 938 aa13.73□□□□□ -0.21
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nap1l3Q794H2 544 aa13.73□□□□□ -0.21
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cfap99A0A140LIX9 648 aa13.73□□□□□ -0.21
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arid4aF8VPQ2 1261 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
Herc3-201ENSMUST00000031823 KhnynQ80U38 671 aa13.73□□□□□ -0.21
Herc3-201ENSMUST00000031823 Terb1Q8C0V1 768 aa13.73□□□□□ -0.21
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Herc3-201ENSMUST00000031823 Aak1Q3UHJ0 959 aa13.72□□□□□ -0.21
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hps6Q8BLY7 805 aa13.72□□□□□ -0.21
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Herc3-201ENSMUST00000031823 Nmt2O70311 529 aa13.72□□□□□ -0.21
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Herc3-201ENSMUST00000031823 Cplx1P63040 134 aa13.72□□□□□ -0.21
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cnnm3Q32NY4 713 aa13.72□□□□□ -0.21
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf287Q9EQB9 759 aa13.72□□□□□ -0.21
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Herc3-201ENSMUST00000031823 Ptrh1Q8BW00 204 aa13.71□□□□□ -0.21
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pus7lQ8CE46 702 aa13.71□□□□□ -0.21
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrrc2Q8VDB8 371 aa13.71□□□□□ -0.21
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Herc3-201ENSMUST00000031823 Kcnq2Q9Z351 759 aa13.71□□□□□ -0.21
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp804bA0A0G2JGH6 1343 aa13.71□□□□□ -0.21
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Herc3-201ENSMUST00000031823 Traf3ip1Q149C2 625 aa13.71□□□□□ -0.21
Herc3-201ENSMUST00000031823 GnptabQ69ZN6 1235 aa13.71□□□□□ -0.21
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm2163Q6PCY5 473 aa13.71□□□□□ -0.21
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Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem59lQ7TNI2 337 aa13.71□□□□□ -0.21
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ndufv1Q91YT0 464 aa13.71□□□□□ -0.21
Herc3-201ENSMUST00000031823 Scn11aQ9R053 1765 aa13.71□□□□□ -0.21
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam186bD3Z420 943 aa13.71□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eef2P58252 858 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 LyarQ08288 388 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tut1Q8R3F9 869 aa13.71□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rnaseh2aQ9CWY8 301 aa13.71□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Aox1O54754 1333 aa13.7□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plekhg2Q6KAU7 1340 aa13.7□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm20425E9Q035 978 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 SrprbP47758 269 aa13.7□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eya3P97480 510 aa13.7□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tom1l2Q5SRX1 507 aa13.7□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pik3ap1Q9EQ32 811 aa13.7□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pnpla6Q3TRM4 1355 aa13.7□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Myh15E9Q264 1925 aa13.7□□□□□ -0.22
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Herc3-201ENSMUST00000031823 Tacc1Q6Y685 774 aa13.7□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Stac3Q8BZ71 360 aa13.7□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdk8Q8R3L8 464 aa13.7□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Txnrd3Q99MD6 652 aa13.7□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Glrx3Q9CQM9 337 aa13.7□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tcof1O08784 1320 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eif6O55135 245 aa13.7□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Map9Q3TRR0 646 aa13.7□□□□□ -0.22
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Herc3-201ENSMUST00000031823 Cnpy3Q9DAU1 276 aa13.7□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc27a3O88561 667 aa13.69□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Myo1bP46735 1107 aa13.69□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ncf1Q09014 390 aa13.69□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmed8Q3UHI4 326 aa13.69□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc82Q6PG04 518 aa13.69□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Terf2ipQ91VL8 393 aa13.69□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cep89Q9CZX2 791 aa13.69□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 D830030K20RikE9PYQ5 218 aa13.69□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm3043K7N693 218 aa13.69□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm16440K7N6G6 218 aa13.69□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm2244L7N2A3 218 aa13.69□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm3278L7N2D2 218 aa13.69□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm8271L7N2E2 218 aa13.69□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lamc2Q61092 1191 aa13.69□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ift74Q8BKE9 600 aa13.69□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rtn1Q8K0T0 780 aa13.69□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Yipf1Q91VU1 306 aa13.69□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Togaram1Q6A070 1776 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 CpdO89001 1377 aa13.68□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 1700003F12RikA2AKE5 210 aa13.68□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cyp2c68K7N6C2 491 aa13.68□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Magea1O89006 320 aa13.68□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Magea5O89009 320 aa13.68□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 DaglaQ6WQJ1 1044 aa13.68□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Magea2Q9R2A2 320 aa13.68□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdc45Q9Z1X9 566 aa13.68□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ifit1Q64282 463 aa13.68□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Usp50Q6P8X6 390 aa13.68□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Camkk2Q8C078 588 aa13.68□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Evc2Q8K1G2 1220 aa13.68□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mrps5Q99N87 432 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Antxr1Q9CZ52 562 aa13.68□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 GabreA2AMW3 916 aa13.68□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Triml1Q8BVP1 470 aa13.68□□□□□ -0.22
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