RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Terb1Q8C0V1 768 aa30.2■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CpvlQ9D3S9 478 aa30.2■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dnajc5P60904 198 aa30.19■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Evc2Q8K1G2 1220 aa30.19■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Klc3Q91W40 508 aa30.19■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ttc14Q9CSP9 761 aa30.19■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Magi2Q9WVQ1 1275 aa30.19■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dnajc25A2ALW5 357 aa30.19■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm10134F6ZQC6 126 aa30.19■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sox30Q8CGW4 782 aa30.19■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zc3h12cQ5DTV4 884 aa30.18■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rcan1Q9JHG6 198 aa30.18■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Wasf1Q8R5H6 559 aa30.18■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trim11Q99PQ2 467 aa30.18■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Abl1P00520 1123 aa30.17■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pik3ap1Q9EQ32 811 aa30.17■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Stk39Q9Z1W9 556 aa30.17■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Bicdl1A0JNT9 577 aa30.17■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Surf1P09925 306 aa30.17■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ctdspl2Q8BG15 465 aa30.17■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Myh6Q02566 1938 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cdc27A2A6Q5 825 aa30.16■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Myo1bP46735 1107 aa30.16■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dnm3Q8BZ98 863 aa30.16■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc150Q8CDI7 1110 aa30.16■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa30.16■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cyp7b1Q60991 507 aa30.15■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Bsdc1Q80Y55 427 aa30.15■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Otud6bQ8K2H2 294 aa30.15■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tfcp2Q9ERA0 502 aa30.15■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dctpp1Q9QY93 170 aa30.15■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pde4bB1AWC9 736 aa30.15■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ampd3O08739 766 aa30.15■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cbx1P83917 185 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Bnip3O55003 187 aa30.14■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Snai1Q02085 264 aa30.14■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc39Q9D5Y1 937 aa30.14■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Spata5Q3UMC0 893 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Panx2Q6IMP4 677 aa30.14■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zfp397Q7TNK4 527 aa30.14■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Scn11aQ9R053 1765 aa30.14■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Stat5bP42232 786 aa30.13■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 IntuQ059U7 942 aa30.13■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 SowahdQ8BY98 327 aa30.13■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 HdlbpQ8VDJ3 1268 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tbc1d8bA3KGB4 1114 aa30.13■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ms4a1P19437 291 aa30.13■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dynll1P63168 89 aa30.13■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 HelbQ6NVF4 1074 aa30.13■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rnf41Q8BH75 317 aa30.13■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tubgcp2Q921G8 905 aa30.13■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ift122Q6NWV3 1182 aa30.12■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Psrc1Q9D0P7 329 aa30.12■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 ParvgQ9ERD8 331 aa30.12■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ube4aE9Q735 1028 aa30.12■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CltaO08585 235 aa30.12■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc7a3P70423 618 aa30.12■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cdc37Q61081 379 aa30.12■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mei4Q8BRM6 389 aa30.12■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tspyl4Q8VD63 406 aa30.12■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cep89Q9CZX2 791 aa30.12■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Polr2dQ9D7M8 142 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hic2Q9JLZ6 619 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CoblQ5NBX1 1337 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AfdnQ9QZQ1 1820 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Stox1B2RQL2 990 aa30.11■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Bap1Q99PU7 728 aa30.11■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prl7d1P04769 244 aa30.11■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fam89aQ14BJ1 175 aa30.11■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 L1td1Q587J6 782 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc27a1Q60714 646 aa30.11■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ddx27Q921N6 760 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Irs4Q9Z0Y7 1216 aa30.11■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Usp49Q6P9L4 685 aa30.1■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rbm15bQ6PHZ5 887 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Olfr118Q7TRJ6 321 aa30.1■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tbc1d5Q80XQ2 815 aa30.1■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Izumo3A6PWV3 263 aa30.1■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sec23aQ01405 765 aa30.1■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Luc7l2Q7TNC4 392 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Elf2Q9JHC9 593 aa30.1■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Epb41l2O70318 988 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Vps16Q920Q4 839 aa30.09■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa30.09■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Q8K2W9 541 aa30.09■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zscan20B2KFW1 1030 aa30.09■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm5624F6ZZG8 207 aa30.09■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kcnd1Q03719 651 aa30.09■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lgr5Q9Z1P4 907 aa30.09■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dync1i1O88485 628 aa30.08■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gtf2f1Q3THK3 508 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pex1Q5BL07 1284 aa30.08■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nek3Q9R0A5 511 aa30.08■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prss40A6H6T1 365 aa30.08■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cyp4x1Q6A152 507 aa30.08■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krt40Q6IFX3 439 aa30.08■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Clec16aQ80U30 1036 aa30.08■■■□□ 2.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pm20d1Q8C165 503 aa30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 55 ms