RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C VRP1P37370 817 aa5.1□□□□□ -1.59
HDA3YPR179C JIP4Q03361 876 aa5.08□□□□□ -1.6
HDA3YPR179C GYP5Q12344 894 aa5.07□□□□□ -1.6
HDA3YPR179C DAN4P47179 1161 aa5.07□□□□□ -1.6
HDA3YPR179C HTA1P04911 132 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
HDA3YPR179C HTA2P04912 132 aa5.04□□□□□ -1.6
HDA3YPR179C MAK11P20484 414 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
HDA3YPR179C PTC4P38089 393 aa5.04□□□□□ -1.6
HDA3YPR179C SRC1Q03707 834 aa5.03□□□□□ -1.6
HDA3YPR179C YDL129WQ07555 291 aa5.02□□□□□ -1.61
HDA3YPR179C RAM2P29703 316 aa5.01□□□□□ -1.61
HDA3YPR179C YEL023CP39992 682 aa5.01□□□□□ -1.61
HDA3YPR179C DCW1P36091 449 aa5□□□□□ -1.61
HDA3YPR179C GRE2Q12068 342 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
HDA3YPR179C GUT1P32190 709 aa4.97□□□□□ -1.61
HDA3YPR179C PTC3P34221 468 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.61
HDA3YPR179C MIF2P35201 549 aa4.96□□□□□ -1.61
HDA3YPR179C NOP53Q12080 455 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
HDA3YPR179C EDS1P38073 919 aa4.95□□□□□ -1.62
HDA3YPR179C ATH1P48016 1211 aa4.95□□□□□ -1.62
HDA3YPR179C COQ8P27697 501 aa4.94□□□□□ -1.62
HDA3YPR179C NST1P53935 1240 aa4.92□□□□□ -1.62
HDA3YPR179C YPL062WQ02781 134 aa4.9□□□□□ -1.63
HDA3YPR179C PML39Q03760 334 aa4.89□□□□□ -1.63
HDA3YPR179C AI4P03878 556 aa4.88□□□□□ -1.63
HDA3YPR179C SOL3P38858 249 aa4.88□□□□□ -1.63
HDA3YPR179C MPH3P0CE00 602 aa4.87□□□□□ -1.63
HDA3YPR179C ARH1P48360 493 aa4.85□□□□□ -1.63
HDA3YPR179C ELP4Q02884 456 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
HDA3YPR179C YGR273CP53329 174 aa4.83□□□□□ -1.64
HDA3YPR179C MID1P41821 548 aa4.82□□□□□ -1.64
HDA3YPR179C YDR344CQ05510 147 aa4.81□□□□□ -1.64
HDA3YPR179C ILV3P39522 585 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
HDA3YPR179C SPT23P35210 1082 aa4.78□□□□□ -1.64
HDA3YPR179C HAP5Q02516 242 aa4.77□□□□□ -1.65
HDA3YPR179C PEX29Q03370 554 aa4.77□□□□□ -1.65
HDA3YPR179C SET1P38827 1080 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
HDA3YPR179C BNI4P53858 892 aa4.76□□□□□ -1.65
HDA3YPR179C MPC54Q08550 464 aa4.75□□□□□ -1.65
HDA3YPR179C SLI15P38283 698 aa4.74□□□□□ -1.65
HDA3YPR179C YML082WQ04533 649 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
HDA3YPR179C KEX1P09620 729 aa4.73□□□□□ -1.65
HDA3YPR179C DPL1Q05567 589 aa4.73□□□□□ -1.65
HDA3YPR179C NMA111P53920 997 aa4.72□□□□□ -1.65
HDA3YPR179C TRK1P12685 1235 aa4.71□□□□□ -1.66
HDA3YPR179C IFH1P39520 1085 aa4.71□□□□□ -1.66
HDA3YPR179C PTC2P39966 464 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
HDA3YPR179C UBP14P38237 781 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
HDA3YPR179C GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data4.69□□□□□ -1.66not detected
HDA3YPR179C YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
HDA3YPR179C ISU2Q12056 156 aa4.69□□□□□ -1.66
HDA3YPR179C PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data4.65□□□□□ -1.66not detected
HDA3YPR179C VHR2P40041 505 aa4.64□□□□□ -1.67
HDA3YPR179C YPR148CQ06523 435 aa4.64□□□□□ -1.67
HDA3YPR179C RPP1BP10622 106 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
HDA3YPR179C RAM1P22007 431 aa4.64□□□□□ -1.67
HDA3YPR179C RAD54P32863 898 aa4.64□□□□□ -1.67
HDA3YPR179C CDC73Q06697 393 aa4.64□□□□□ -1.67
HDA3YPR179C YDR090CQ03193 310 aa4.62□□□□□ -1.67
HDA3YPR179C YPR015CQ12531 247 aa4.62□□□□□ -1.67
HDA3YPR179C REF2P42073 533 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
HDA3YPR179C SAS4Q04003 481 aa4.59□□□□□ -1.67
HDA3YPR179C RAS1P01119 309 aa4.58□□□□□ -1.68
HDA3YPR179C GAP1P19145 602 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
HDA3YPR179C KIC1P38692 1080 aa4.58□□□□□ -1.68
HDA3YPR179C MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
HDA3YPR179C PDR1P12383 1068 aa4.56□□□□□ -1.68
HDA3YPR179C CSC1Q06538 782 aa4.56□□□□□ -1.68
HDA3YPR179C TFB4Q12004 338 aa4.56□□□□□ -1.68
HDA3YPR179C GAR1P28007 205 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
HDA3YPR179C GYP1Q08484 637 aa4.55□□□□□ -1.68
HDA3YPR179C COX6P00427 148 aa4.54□□□□□ -1.68
HDA3YPR179C PEX21P50091 288 aa4.53□□□□□ -1.68
HDA3YPR179C AMS1P22855 1083 aa4.53□□□□□ -1.68
HDA3YPR179C ORC6P38826 435 aa4.53□□□□□ -1.68
HDA3YPR179C DMA1P38823 416 aa4.52□□□□□ -1.69
HDA3YPR179C VPS70P47161 811 aa4.52□□□□□ -1.69
HDA3YPR179C SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
HDA3YPR179C MRF1P30775 413 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
HDA3YPR179C BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
HDA3YPR179C YRR1Q12172 810 aa4.51□□□□□ -1.69
HDA3YPR179C SDH2P21801 266 aa4.51□□□□□ -1.69
HDA3YPR179C PRT1P06103 763 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
HDA3YPR179C CKB1P43639 278 aa4.49□□□□□ -1.69
HDA3YPR179C TUM1Q08686 304 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
HDA3YPR179C MVP1P40959 511 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
HDA3YPR179C STR2P47164 639 aa4.49□□□□□ -1.69
HDA3YPR179C YEL077CQ3E7X8 1277 aa4.48□□□□□ -1.69
HDA3YPR179C NUD1P32336 851 aa4.47□□□□□ -1.69
HDA3YPR179C ISM1P48526 1002 aa4.47□□□□□ -1.69
HDA3YPR179C RGR1P19263 1082 aa4.46□□□□□ -1.7
HDA3YPR179C NPL4P33755 580 aa4.46□□□□□ -1.7
HDA3YPR179C ERG12P07277 443 aa4.43□□□□□ -1.7
HDA3YPR179C PBS2P08018 668 aa4.43□□□□□ -1.7
HDA3YPR179C SEC2P17065 759 aa4.43□□□□□ -1.7
HDA3YPR179C YPR109WQ06104 294 aa4.43□□□□□ -1.7
HDA3YPR179C TY1A-DR4O74302 440 aa4.42□□□□□ -1.7
HDA3YPR179C TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
HDA3YPR179C TY1A-AP0CX57 440 aa4.42□□□□□ -1.7
HDA3YPR179C TY1A-PR1P0CX58 440 aa4.42□□□□□ -1.7
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