RNA–Protein interactions for RNA: YHR177W

YHR177W, Transcript of Putative transcription factor containing a WOPR domain, yeastyeast

Gene YHR177W, Length 1,362 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR177WYHR177W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.84
YHR177WYHR177W DCW1P36091 449 aa9.77□□□□□ -0.84
YHR177WYHR177W BCK2P33306 851 aa9.75□□□□□ -0.85
YHR177WYHR177W YEL023CP39992 682 aa9.75□□□□□ -0.85
YHR177WYHR177W PRE3P38624 215 aa9.73□□□□□ -0.85
YHR177WYHR177W GRE2Q12068 342 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
YHR177WYHR177W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
YHR177WYHR177W PML39Q03760 334 aa9.57□□□□□ -0.88
YHR177WYHR177W MAK11P20484 414 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
YHR177WYHR177W MIF2P35201 549 aa9.53□□□□□ -0.88
YHR177WYHR177W GUT1P32190 709 aa9.52□□□□□ -0.88
YHR177WYHR177W VRP1P37370 817 aa9.52□□□□□ -0.88
YHR177WYHR177W XDJ1P39102 459 aa9.52□□□□□ -0.88
YHR177WYHR177W ATH1P48016 1211 aa9.52□□□□□ -0.88
YHR177WYHR177W YDR344CQ05510 147 aa9.52□□□□□ -0.88
YHR177WYHR177W ELP4Q02884 456 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
YHR177WYHR177W PTC3P34221 468 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
YHR177WYHR177W EDS1P38073 919 aa9.49□□□□□ -0.89
YHR177WYHR177W RAM2P29703 316 aa9.48□□□□□ -0.89
YHR177WYHR177W ARH1P48360 493 aa9.45□□□□□ -0.9
YHR177WYHR177W NST1P53935 1240 aa9.45□□□□□ -0.9
YHR177WYHR177W MID1P41821 548 aa9.41□□□□□ -0.9
YHR177WYHR177W COQ8P27697 501 aa9.39□□□□□ -0.91
YHR177WYHR177W SOL3P38858 249 aa9.38□□□□□ -0.91
YHR177WYHR177W AI4P03878 556 aa9.36□□□□□ -0.91
YHR177WYHR177W MPH3P0CE00 602 aa9.36□□□□□ -0.91
YHR177WYHR177W SPT23P35210 1082 aa9.34□□□□□ -0.91
YHR177WYHR177W DPS1P04802 557 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
YHR177WYHR177W PEX29Q03370 554 aa9.32□□□□□ -0.92
YHR177WYHR177W HAP5Q02516 242 aa9.28□□□□□ -0.92
YHR177WYHR177W NOP53Q12080 455 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
YHR177WYHR177W ILV3P39522 585 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
YHR177WYHR177W BNI4P53858 892 aa9.24□□□□□ -0.93
YHR177WYHR177W YGR273CP53329 174 aa9.23□□□□□ -0.93
YHR177WYHR177W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
YHR177WYHR177W TAF7Q05021 590 aa9.21□□□□□ -0.94
YHR177WYHR177W MPC54Q08550 464 aa9.19□□□□□ -0.94
YHR177WYHR177W PTC2P39966 464 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
YHR177WYHR177W NMA111P53920 997 aa9.14□□□□□ -0.95
YHR177WYHR177W SLI15P38283 698 aa9.12□□□□□ -0.95
YHR177WYHR177W SRC1Q03707 834 aa9.1□□□□□ -0.95
YHR177WYHR177W DPL1Q05567 589 aa9.09□□□□□ -0.95
YHR177WYHR177W DMA1P38823 416 aa9.03□□□□□ -0.96
YHR177WYHR177W ISU2Q12056 156 aa9□□□□□ -0.97
YHR177WYHR177W KEX1P09620 729 aa8.99□□□□□ -0.97
YHR177WYHR177W YPR015CQ12531 247 aa8.99□□□□□ -0.97
YHR177WYHR177W RAM1P22007 431 aa8.97□□□□□ -0.97
YHR177WYHR177W RAS1P01119 309 aa8.96□□□□□ -0.98
YHR177WYHR177W CDC73Q06697 393 aa8.92□□□□□ -0.98
YHR177WYHR177W UBP14P38237 781 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
YHR177WYHR177W RGA2Q06407 1009 aa8.88□□□□□ -0.99
YHR177WYHR177W GYP1Q08484 637 aa8.88□□□□□ -0.99
YHR177WYHR177W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
YHR177WYHR177W SET1P38827 1080 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
YHR177WYHR177W AMS1P22855 1083 aa8.86□□□□□ -0.99
YHR177WYHR177W RGA1P39083 1007 aa8.86□□□□□ -0.99
YHR177WYHR177W PDR1P12383 1068 aa8.84□□□□□ -0.99
YHR177WYHR177W SAS4Q04003 481 aa8.84□□□□□ -0.99
YHR177WYHR177W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data8.82□□□□□ -1not detected
YHR177WYHR177W VHR2P40041 505 aa8.82□□□□□ -1
YHR177WYHR177W TRK1P12685 1235 aa8.8□□□□□ -1
YHR177WYHR177W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
YHR177WYHR177W RAD54P32863 898 aa8.79□□□□□ -1
YHR177WYHR177W SDH2P21801 266 aa8.78□□□□□ -1
YHR177WYHR177W YEL077CQ3E7X8 1277 aa8.72□□□□□ -1.01
YHR177WYHR177W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
YHR177WYHR177W YDR090CQ03193 310 aa8.68□□□□□ -1.02
YHR177WYHR177W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
YHR177WYHR177W PRT1P06103 763 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
YHR177WYHR177W YRR1Q12172 810 aa8.65□□□□□ -1.02
YHR177WYHR177W KIC1P38692 1080 aa8.64□□□□□ -1.03
YHR177WYHR177W IFH1P39520 1085 aa8.64□□□□□ -1.03
YHR177WYHR177W PEX21P50091 288 aa8.64□□□□□ -1.03
YHR177WYHR177W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
YHR177WYHR177W LEO1P38439 464 aa8.61□□□□□ -1.03
YHR177WYHR177W CSC1Q06538 782 aa8.61□□□□□ -1.03
YHR177WYHR177W TFB4Q12004 338 aa8.61□□□□□ -1.03
YHR177WYHR177W STR2P47164 639 aa8.61□□□□□ -1.03
YHR177WYHR177W ISM1P48526 1002 aa8.59□□□□□ -1.03
YHR177WYHR177W ERG12P07277 443 aa8.57□□□□□ -1.04
YHR177WYHR177W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
YHR177WYHR177W NUD1P32336 851 aa8.56□□□□□ -1.04
YHR177WYHR177W REF2P42073 533 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
YHR177WYHR177W NPL4P33755 580 aa8.52□□□□□ -1.05
YHR177WYHR177W YPR148CQ06523 435 aa8.51□□□□□ -1.05
YHR177WYHR177W YPL062WQ02781 134 aa8.5□□□□□ -1.05
YHR177WYHR177W ORC6P38826 435 aa8.49□□□□□ -1.05
YHR177WYHR177W CST6P40535 587 aa8.49□□□□□ -1.05
YHR177WYHR177W BRE2P43132 505 aa8.48□□□□□ -1.05
YHR177WYHR177W GCD11P32481 527 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
YHR177WYHR177W AIR1P40507 360 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
YHR177WYHR177W GCR2Q01722 534 aa8.47□□□□□ -1.05
YHR177WYHR177W TY1A-DR4O74302 440 aa8.46□□□□□ -1.06
YHR177WYHR177W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
YHR177WYHR177W TY1A-AP0CX57 440 aa8.46□□□□□ -1.06
YHR177WYHR177W TY1A-PR1P0CX58 440 aa8.46□□□□□ -1.06
YHR177WYHR177W TY1A-ORP0CX59 440 aa8.46□□□□□ -1.06
YHR177WYHR177W TY1A-PR2P0CX60 440 aa8.46□□□□□ -1.06
YHR177WYHR177W TY1A-DR5P0CX65 440 aa8.46□□□□□ -1.06
YHR177WYHR177W TY1A-ER2P0CX66 440 aa8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.1 ms