RNA–Protein interactions for RNA: YBL078C

ATG8, Transcript of Component of autophagosomes and Cvt vesicles, yeastyeast

Gene ATG8, Length 354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Peroxisome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG8YBL078C YNL035CP53962 389 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
ATG8YBL078C GRE2Q12068 342 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
ATG8YBL078C YJL171CP46992 396 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG8YBL078C SEC61P32915 480 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG8YBL078C ATH1P48016 1211 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG8YBL078C JIP4Q03361 876 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG8YBL078C GUT1P32190 709 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG8YBL078C NCR1Q12200 1170 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG8YBL078C NOP53Q12080 455 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
ATG8YBL078C YEL023CP39992 682 aa7.49□□□□□ -1.21
ATG8YBL078C DAN4P47179 1161 aa7.49□□□□□ -1.21
ATG8YBL078C PTC4P38089 393 aa7.48□□□□□ -1.21
ATG8YBL078C BMT6Q12291 365 aa7.48□□□□□ -1.21
ATG8YBL078C TFG1P41895 735 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
ATG8YBL078C SET1P38827 1080 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
ATG8YBL078C YDL129WQ07555 291 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG8YBL078C SOL3P38858 249 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG8YBL078C NST1P53935 1240 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG8YBL078C SAP30P38429 201 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG8YBL078C AI4P03878 556 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG8YBL078C MPH3P0CE00 602 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG8YBL078C YGR273CP53329 174 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG8YBL078C PML39Q03760 334 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG8YBL078C LEU3P08638 886 aa7.32□□□□□ -1.24
ATG8YBL078C IFH1P39520 1085 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG8YBL078C ILV3P39522 585 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ATG8YBL078C MID1P41821 548 aa7.26□□□□□ -1.25
ATG8YBL078C SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
ATG8YBL078C CHL1P22516 861 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
ATG8YBL078C PRE3P38624 215 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG8YBL078C YPR148CQ06523 435 aa7.23□□□□□ -1.25
ATG8YBL078C KEX1P09620 729 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG8YBL078C PEX29Q03370 554 aa7.21□□□□□ -1.26
ATG8YBL078C UBP14P38237 781 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
ATG8YBL078C YDR344CQ05510 147 aa7.2□□□□□ -1.26
ATG8YBL078C SLI15P38283 698 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG8YBL078C VHR2P40041 505 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG8YBL078C ARH1P48360 493 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG8YBL078C ELP4Q02884 456 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ATG8YBL078C YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ATG8YBL078C VPS70P47161 811 aa7.16□□□□□ -1.26
ATG8YBL078C DMA2P53924 522 aa7.16□□□□□ -1.26
ATG8YBL078C MPC54Q08550 464 aa7.16□□□□□ -1.26
ATG8YBL078C RAD54P32863 898 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG8YBL078C BCK2P33306 851 aa7.13□□□□□ -1.27
ATG8YBL078C PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data7.13□□□□□ -1.27not detected
ATG8YBL078C REF2P42073 533 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ATG8YBL078C HAP5Q02516 242 aa7.13□□□□□ -1.27
ATG8YBL078C DPL1Q05567 589 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG8YBL078C SPT23P35210 1082 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG8YBL078C NMA111P53920 997 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG8YBL078C YDR090CQ03193 310 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG8YBL078C KIC1P38692 1080 aa7.08□□□□□ -1.28
ATG8YBL078C BNI4P53858 892 aa7.08□□□□□ -1.28
ATG8YBL078C CDC73Q06697 393 aa7.08□□□□□ -1.28
ATG8YBL078C RPP1BP10622 106 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
ATG8YBL078C VRP1P37370 817 aa7.06□□□□□ -1.28
ATG8YBL078C CKB1P43639 278 aa7.06□□□□□ -1.28
ATG8YBL078C RPN1P38764 993 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
ATG8YBL078C ISU2Q12056 156 aa7.05□□□□□ -1.28
ATG8YBL078C PTC2P39966 464 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
ATG8YBL078C MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
ATG8YBL078C COX6P00427 148 aa7.02□□□□□ -1.29
ATG8YBL078C YML082WQ04533 649 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
ATG8YBL078C XDJ1P39102 459 aa7□□□□□ -1.29
ATG8YBL078C PBS2P08018 668 aa6.97□□□□□ -1.29
ATG8YBL078C GAP1P19145 602 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
ATG8YBL078C CSC1Q06538 782 aa6.96□□□□□ -1.3
ATG8YBL078C ORC6P38826 435 aa6.95□□□□□ -1.3
ATG8YBL078C PEX21P50091 288 aa6.95□□□□□ -1.3
ATG8YBL078C RAM1P22007 431 aa6.94□□□□□ -1.3
ATG8YBL078C RLF2Q12495 606 aa6.94□□□□□ -1.3
ATG8YBL078C PDR1P12383 1068 aa6.93□□□□□ -1.3
ATG8YBL078C TFB4Q12004 338 aa6.93□□□□□ -1.3
ATG8YBL078C YPR015CQ12531 247 aa6.92□□□□□ -1.3
ATG8YBL078C YRR1Q12172 810 aa6.91□□□□□ -1.3
ATG8YBL078C DSF2P38213 736 aa6.9□□□□□ -1.3
ATG8YBL078C SPB4P25808 606 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
ATG8YBL078C TUM1Q08686 304 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
ATG8YBL078C MAM3Q12296 706 aa6.89□□□□□ -1.31
ATG8YBL078C MVP1P40959 511 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
ATG8YBL078C RGR1P19263 1082 aa6.86□□□□□ -1.31
ATG8YBL078C GYP1Q08484 637 aa6.85□□□□□ -1.31
ATG8YBL078C IES2P40154 320 aa6.84□□□□□ -1.31
ATG8YBL078C DPS1P04802 557 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
ATG8YBL078C NUD1P32336 851 aa6.83□□□□□ -1.32
ATG8YBL078C PSE1P32337 1089 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
ATG8YBL078C YPR109WQ06104 294 aa6.83□□□□□ -1.32
ATG8YBL078C SAS4Q04003 481 aa6.82□□□□□ -1.32
ATG8YBL078C STR2P47164 639 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG8YBL078C ISM1P48526 1002 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG8YBL078C BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
ATG8YBL078C NPL4P33755 580 aa6.8□□□□□ -1.32
ATG8YBL078C NUP42P49686 430 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
ATG8YBL078C PRT1P06103 763 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
ATG8YBL078C CLB5P30283 435 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG8YBL078C DIT2P21595 489 aa6.75□□□□□ -1.33
ATG8YBL078C GCD11P32481 527 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
ATG8YBL078C SDH2P21801 266 aa6.73□□□□□ -1.33
ATG8YBL078C MRF1P30775 413 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.3 ms