RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637694.1

CNTNAP2-222, Transcript of contactin associated protein like 2, human

TSL 5

Gene CNTNAP2, Length 2,213 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ERCC6	Q03468	1493 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		12.13	□□□□□ -0.47
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HMGXB3	Q12766	1538 aa		12.13	□□□□□ -0.47
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
CNTNAP2-222	ENST00000637694	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
CNTNAP2-222	ENST00000637694	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCER2	I3L3R5	266 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CNTNAP2-222	ENST00000637694	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
CNTNAP2-222	ENST00000637694	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CUX2	O14529	1486 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CNTNAP2-222	ENST00000637694	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ABCC8	Q09428	1581 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CNTNAP2-222	ENST00000637694	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
CNTNAP2-222	ENST00000637694	WIZ	O95785	1651 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZMYND15	Q9H091	742 aa		12.02	□□□□□ -0.48
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SOGA1	O94964	1423 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CNTNAP2-222	ENST00000637694	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ANP32C	O43423	234 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NEFM	P07197	916 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CNTNAP2-222	ENST00000637694	USP35	Q9P2H5	1018 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	11.97	□□□□□ -0.49
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ADRA2B	P18089	450 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CLIP1	P30622	1438 aa		11.96	□□□□□ -0.5
CNTNAP2-222	ENST00000637694	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GOLGA3	Q08378	1498 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CNTNAP2-222	ENST00000637694	EEA1	Q15075	1411 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CNTNAP2-222	ENST00000637694	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CNTNAP2-222	ENST00000637694	WDR97	A6NE52	1622 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MAPKBP1	O60336	1514 aa		11.9	□□□□□ -0.51
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GSE1	Q14687	1217 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		11.85	□□□□□ -0.51
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		11.85	□□□□□ -0.51
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		11.85	□□□□□ -0.51
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		11.8	□□□□□ -0.52
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		11.8	□□□□□ -0.52
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		11.8	□□□□□ -0.52
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
CNTNAP2-222	ENST00000637694	WDR62	O43379	1518 aa		11.78	□□□□□ -0.52
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KIF21B	O75037	1637 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NFKBIB	Q15653	356 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC184	Q52MB2	194 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CNTNAP2-222	ENST00000637694		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CFTR	P13569	1480 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
CNTNAP2-222	ENST00000637694	AKNA	Q7Z591	1439 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CNTNAP2-222	ENST00000637694	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.54
CNTNAP2-222	ENST00000637694	AAMP	Q13685	434 aa		11.71	□□□□□ -0.54
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		11.71	□□□□□ -0.54
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PDE4A	P27815	886 aa		11.7	□□□□□ -0.54
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FGD1	P98174	961 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CNTNAP2-222	ENST00000637694	BACH2	Q9BYV9	841 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PRDM2	Q13029	1718 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		11.65	□□□□□ -0.55
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SLC4A3	P48751	1232 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PDE4C	Q08493	712 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ARAP1	Q96P48	1450 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55

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