RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 TIAM1Q13009 1591 aa27.77■■■□□ 2.04
CLN8-211ENST00000636934 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
CLN8-211ENST00000636934 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
CLN8-211ENST00000636934 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.69■■■□□ 2.02
CLN8-211ENST00000636934 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.67■■■□□ 2.02
CLN8-211ENST00000636934 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.66■■■□□ 2.02
CLN8-211ENST00000636934 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.64■■■□□ 2.02
CLN8-211ENST00000636934 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.64■■■□□ 2.02
CLN8-211ENST00000636934 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.01
CLN8-211ENST00000636934 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.63■■■□□ 2.01
CLN8-211ENST00000636934 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.6■■■□□ 2.01
CLN8-211ENST00000636934 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.6■■■□□ 2.01
CLN8-211ENST00000636934 FMN1Q68DA7 1419 aa27.6■■■□□ 2.01
CLN8-211ENST00000636934 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.57■■■□□ 2
CLN8-211ENST00000636934 PBRM1Q86U86 1689 aa27.56■■■□□ 2
CLN8-211ENST00000636934 P3H3Q8IVL6 736 aa27.55■■■□□ 2
CLN8-211ENST00000636934 SAMD9Q5K651 1589 aa27.55■■■□□ 2
CLN8-211ENST00000636934 IFT140Q96RY7 1462 aa27.49■■□□□ 1.99
CLN8-211ENST00000636934 WDR62O43379 1518 aa27.49■■□□□ 1.99
CLN8-211ENST00000636934 GRIN2BQ13224 1484 aa27.46■■□□□ 1.99
CLN8-211ENST00000636934 ADAMTS12P58397 1594 aa27.45■■□□□ 1.99
CLN8-211ENST00000636934 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
CLN8-211ENST00000636934 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.43■■□□□ 1.98
CLN8-211ENST00000636934 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
CLN8-211ENST00000636934 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
CLN8-211ENST00000636934 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.39■■□□□ 1.98
CLN8-211ENST00000636934 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
CLN8-211ENST00000636934 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.34■■□□□ 1.978e-6■■□□□ 11.9
CLN8-211ENST00000636934 IQGAP2Q13576 1575 aa27.34■■□□□ 1.97
CLN8-211ENST00000636934 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
CLN8-211ENST00000636934 ERCC6Q03468 1493 aa27.31■■□□□ 1.96
CLN8-211ENST00000636934 ITGAEP38570 1179 aa27.27■■□□□ 1.96
CLN8-211ENST00000636934 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.27■■□□□ 1.96
CLN8-211ENST00000636934 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.25■■□□□ 1.95
CLN8-211ENST00000636934 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.25■■□□□ 1.95
CLN8-211ENST00000636934 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CLN8-211ENST00000636934 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
CLN8-211ENST00000636934 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.22■■□□□ 1.95
CLN8-211ENST00000636934 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.22■■□□□ 1.95
CLN8-211ENST00000636934 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.22■■□□□ 1.95
CLN8-211ENST00000636934 HECW1Q76N89 1606 aa27.2■■□□□ 1.95
CLN8-211ENST00000636934 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.2■■□□□ 1.94
CLN8-211ENST00000636934 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
CLN8-211ENST00000636934 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.19■■□□□ 1.94
CLN8-211ENST00000636934 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
CLN8-211ENST00000636934 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.16■■□□□ 1.94
CLN8-211ENST00000636934 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
CLN8-211ENST00000636934 GRIN2AQ12879 1464 aa27.12■■□□□ 1.93
CLN8-211ENST00000636934 NCOA2Q15596 1464 aa27.12■■□□□ 1.93
CLN8-211ENST00000636934 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.1■■□□□ 1.93
CLN8-211ENST00000636934 ARHGEF11O15085 1522 aa27.05■■□□□ 1.92
CLN8-211ENST00000636934 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
CLN8-211ENST00000636934 KIAA0556O60303 1618 aa27.04■■□□□ 1.92
CLN8-211ENST00000636934 SYNJ2O15056 1496 aa27.02■■□□□ 1.92
CLN8-211ENST00000636934 MAPKBP1O60336 1514 aa27.02■■□□□ 1.92
CLN8-211ENST00000636934 DISP1Q96F81 1524 aa26.99■■□□□ 1.91
CLN8-211ENST00000636934 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.98■■□□□ 1.91
CLN8-211ENST00000636934 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.97■■□□□ 1.91
CLN8-211ENST00000636934 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
CLN8-211ENST00000636934 HFM1A2PYH4 1435 aa26.94■■□□□ 1.9
CLN8-211ENST00000636934 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
CLN8-211ENST00000636934 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
CLN8-211ENST00000636934 MIA2Q96PC5 1412 aa26.9■■□□□ 1.9
CLN8-211ENST00000636934 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.89■■□□□ 1.9
CLN8-211ENST00000636934 CEP170Q5SW79 1584 aa26.89■■□□□ 1.9
CLN8-211ENST00000636934 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.89■■□□□ 1.9
CLN8-211ENST00000636934 NUP160Q12769 1436 aa26.86■■□□□ 1.89
CLN8-211ENST00000636934 PTPRKQ15262 1439 aa26.85■■□□□ 1.89
CLN8-211ENST00000636934 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CLN8-211ENST00000636934 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.84■■□□□ 1.89
CLN8-211ENST00000636934 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CLN8-211ENST00000636934 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
CLN8-211ENST00000636934 UACAQ9BZF9 1416 aa26.81■■□□□ 1.88
CLN8-211ENST00000636934 NAIPQ13075 1403 aa26.81■■□□□ 1.88
CLN8-211ENST00000636934 AKNAQ7Z591 1439 aa26.8■■□□□ 1.88
CLN8-211ENST00000636934 FBLN2P98095 1184 aa26.77■■□□□ 1.88
CLN8-211ENST00000636934 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.75■■□□□ 1.87
CLN8-211ENST00000636934 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CLN8-211ENST00000636934 JPH4Q96JJ6 628 aa26.72■■□□□ 1.87
CLN8-211ENST00000636934 MIER1Q8N108 512 aa26.71■■□□□ 1.87
CLN8-211ENST00000636934 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.69■■□□□ 1.86
CLN8-211ENST00000636934 ARID3CA6NKF2 412 aa26.69■■□□□ 1.86
CLN8-211ENST00000636934 NEUROD1Q13562 356 aa26.69■■□□□ 1.86
CLN8-211ENST00000636934 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
CLN8-211ENST00000636934 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.63■■□□□ 1.85
CLN8-211ENST00000636934 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.63■■□□□ 1.85
CLN8-211ENST00000636934 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.63■■□□□ 1.85
CLN8-211ENST00000636934 ROCK1Q13464 1354 aa26.62■■□□□ 1.85
CLN8-211ENST00000636934 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.62■■□□□ 1.85
CLN8-211ENST00000636934 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
CLN8-211ENST00000636934 DAPK1P53355 1430 aa26.59■■□□□ 1.85
CLN8-211ENST00000636934 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
CLN8-211ENST00000636934 ABCA8O94911 1581 aa26.59■■□□□ 1.85
CLN8-211ENST00000636934 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.58■■□□□ 1.85
CLN8-211ENST00000636934 TONSLQ96HA7 1378 aa26.58■■□□□ 1.85
CLN8-211ENST00000636934 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
CLN8-211ENST00000636934 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.57■■□□□ 1.84
CLN8-211ENST00000636934 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
CLN8-211ENST00000636934 ABCC5O15440 1437 aa26.52■■□□□ 1.84
CLN8-211ENST00000636934 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
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