RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626119.2

COPS7A-222, Transcript of COP9 signalosome subunit 7A, human

TSL 3 BASIC

Gene COPS7A, Length 1,768 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS7A-222	ENST00000626119	TIAM1	Q13009	1591 aa		30.09	■■■□□ 2.41
COPS7A-222	ENST00000626119	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	30.03	■■■□□ 2.4
COPS7A-222	ENST00000626119	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	30.01	■■■□□ 2.4
COPS7A-222	ENST00000626119	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	30.01	■■■□□ 2.39
COPS7A-222	ENST00000626119	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.98	■■■□□ 2.39
COPS7A-222	ENST00000626119	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		29.97	■■■□□ 2.39
COPS7A-222	ENST00000626119	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		29.96	■■■□□ 2.39
COPS7A-222	ENST00000626119	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		29.96	■■■□□ 2.39
COPS7A-222	ENST00000626119	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		29.96	■■■□□ 2.39
COPS7A-222	ENST00000626119	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		29.95	■■■□□ 2.39
COPS7A-222	ENST00000626119	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		29.92	■■■□□ 2.38
COPS7A-222	ENST00000626119	FMN1	Q68DA7	1419 aa		29.92	■■■□□ 2.38
COPS7A-222	ENST00000626119	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	29.91	■■■□□ 2.38
COPS7A-222	ENST00000626119	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		29.88	■■■□□ 2.37
COPS7A-222	ENST00000626119	SAMD9	Q5K651	1589 aa		29.86	■■■□□ 2.37
COPS7A-222	ENST00000626119	PBRM1	Q86U86	1689 aa		29.81	■■■□□ 2.36
COPS7A-222	ENST00000626119	P3H3	Q8IVL6	736 aa		29.8	■■■□□ 2.36
COPS7A-222	ENST00000626119	WDR62	O43379	1518 aa		29.79	■■■□□ 2.36
COPS7A-222	ENST00000626119	IFT140	Q96RY7	1462 aa		29.79	■■■□□ 2.36
COPS7A-222	ENST00000626119	GRIN2B	Q13224	1484 aa		29.75	■■■□□ 2.35
COPS7A-222	ENST00000626119	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		29.74	■■■□□ 2.35
COPS7A-222	ENST00000626119	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	29.73	■■■□□ 2.35
COPS7A-222	ENST00000626119	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	29.73	■■■□□ 2.35
COPS7A-222	ENST00000626119	ADAMTS12	P58397	1594 aa		29.72	■■■□□ 2.35
COPS7A-222	ENST00000626119	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	29.7	■■■□□ 2.35
COPS7A-222	ENST00000626119	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		29.69	■■■□□ 2.34
COPS7A-222	ENST00000626119	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	29.67	■■■□□ 2.34
COPS7A-222	ENST00000626119	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	29.64	■■■□□ 2.34
COPS7A-222	ENST00000626119	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	29.62	■■■□□ 2.33
COPS7A-222	ENST00000626119	IQGAP2	Q13576	1575 aa		29.61	■■■□□ 2.33
COPS7A-222	ENST00000626119	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		29.54	■■■□□ 2.32
COPS7A-222	ENST00000626119	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		29.54	■■■□□ 2.32
COPS7A-222	ENST00000626119	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		29.53	■■■□□ 2.32
COPS7A-222	ENST00000626119	ERCC6	Q03468	1493 aa		29.52	■■■□□ 2.32
COPS7A-222	ENST00000626119	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		29.51	■■■□□ 2.31
COPS7A-222	ENST00000626119	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		29.51	■■■□□ 2.31
COPS7A-222	ENST00000626119	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	29.51	■■■□□ 2.31
COPS7A-222	ENST00000626119	ITGAE	P38570	1179 aa		29.49	■■■□□ 2.31
COPS7A-222	ENST00000626119	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		29.49	■■■□□ 2.31
COPS7A-222	ENST00000626119	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	29.47	■■■□□ 2.31
COPS7A-222	ENST00000626119	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		29.46	■■■□□ 2.31
COPS7A-222	ENST00000626119	HECW1	Q76N89	1606 aa		29.46	■■■□□ 2.31
COPS7A-222	ENST00000626119	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		29.46	■■■□□ 2.31
COPS7A-222	ENST00000626119	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		29.45	■■■□□ 2.31
COPS7A-222	ENST00000626119	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	29.44	■■■□□ 2.3
COPS7A-222	ENST00000626119	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	29.43	■■■□□ 2.3
COPS7A-222	ENST00000626119	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	29.41	■■■□□ 2.3
COPS7A-222	ENST00000626119	NCOA2	Q15596	1464 aa		29.39	■■■□□ 2.3
COPS7A-222	ENST00000626119	GRIN2A	Q12879	1464 aa		29.38	■■■□□ 2.29
COPS7A-222	ENST00000626119	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		29.37	■■■□□ 2.29
COPS7A-222	ENST00000626119	ARHGEF11	O15085	1522 aa		29.36	■■■□□ 2.29
COPS7A-222	ENST00000626119	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	29.31	■■■□□ 2.28
COPS7A-222	ENST00000626119	MAPKBP1	O60336	1514 aa		29.3	■■■□□ 2.28
COPS7A-222	ENST00000626119	KIAA0556	O60303	1618 aa		29.28	■■■□□ 2.28
COPS7A-222	ENST00000626119	SYNJ2	O15056	1496 aa		29.28	■■■□□ 2.28
COPS7A-222	ENST00000626119	DISP1	Q96F81	1524 aa		29.25	■■■□□ 2.27
COPS7A-222	ENST00000626119	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		29.24	■■■□□ 2.27
COPS7A-222	ENST00000626119	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		29.23	■■■□□ 2.27
COPS7A-222	ENST00000626119	HFM1	A2PYH4	1435 aa		29.22	■■■□□ 2.27
COPS7A-222	ENST00000626119	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	29.21	■■■□□ 2.27
COPS7A-222	ENST00000626119	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		29.2	■■■□□ 2.26
COPS7A-222	ENST00000626119	MIA2	Q96PC5	1412 aa		29.18	■■■□□ 2.26
COPS7A-222	ENST00000626119	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
COPS7A-222	ENST00000626119	NUP160	Q12769	1436 aa		29.13	■■■□□ 2.25
COPS7A-222	ENST00000626119	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		29.12	■■■□□ 2.25
COPS7A-222	ENST00000626119	CEP170	Q5SW79	1584 aa		29.12	■■■□□ 2.25
COPS7A-222	ENST00000626119	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	29.11	■■■□□ 2.25
COPS7A-222	ENST00000626119	PTPRK	Q15262	1439 aa		29.11	■■■□□ 2.25
COPS7A-222	ENST00000626119	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
COPS7A-222	ENST00000626119	AKNA	Q7Z591	1439 aa		29.09	■■■□□ 2.25
COPS7A-222	ENST00000626119	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
COPS7A-222	ENST00000626119	UACA	Q9BZF9	1416 aa		29.08	■■■□□ 2.25
COPS7A-222	ENST00000626119	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		29.08	■■■□□ 2.25
COPS7A-222	ENST00000626119	NAIP	Q13075	1403 aa		29.07	■■■□□ 2.24
COPS7A-222	ENST00000626119	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
COPS7A-222	ENST00000626119	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
COPS7A-222	ENST00000626119	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		28.97	■■■□□ 2.23
COPS7A-222	ENST00000626119	JPH4	Q96JJ6	628 aa		28.96	■■■□□ 2.23
COPS7A-222	ENST00000626119	MIER1	Q8N108	512 aa		28.95	■■■□□ 2.22
COPS7A-222	ENST00000626119	FBLN2	P98095	1184 aa		28.94	■■■□□ 2.22
COPS7A-222	ENST00000626119	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
COPS7A-222	ENST00000626119	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		28.91	■■■□□ 2.22
COPS7A-222	ENST00000626119	ROCK1	Q13464	1354 aa		28.88	■■■□□ 2.21
COPS7A-222	ENST00000626119	NEUROD1	Q13562	356 aa		28.88	■■■□□ 2.21
COPS7A-222	ENST00000626119	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		28.86	■■■□□ 2.21
COPS7A-222	ENST00000626119	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		28.85	■■■□□ 2.21
COPS7A-222	ENST00000626119	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
COPS7A-222	ENST00000626119	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
COPS7A-222	ENST00000626119	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
COPS7A-222	ENST00000626119	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		28.83	■■■□□ 2.21
COPS7A-222	ENST00000626119	ARID3C	A6NKF2	412 aa		28.82	■■■□□ 2.2
COPS7A-222	ENST00000626119	DAPK1	P53355	1430 aa		28.82	■■■□□ 2.2
COPS7A-222	ENST00000626119	ABCA8	O94911	1581 aa		28.81	■■■□□ 2.2
COPS7A-222	ENST00000626119	TONSL	Q96HA7	1378 aa		28.79	■■■□□ 2.2
COPS7A-222	ENST00000626119	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		28.78	■■■□□ 2.2
COPS7A-222	ENST00000626119	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
COPS7A-222	ENST00000626119	ABCC5	O15440	1437 aa		28.75	■■■□□ 2.19
COPS7A-222	ENST00000626119	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		28.75	■■■□□ 2.19
COPS7A-222	ENST00000626119	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
COPS7A-222	ENST00000626119	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		28.68	■■■□□ 2.18

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