RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617991.4

RAB7B-202, Transcript of RAB7B, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RAB7B, Length 3,014 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7B-202ENST00000617991 MAPKBP1O60336 1514 aa16.12■□□□□ 0.17
RAB7B-202ENST00000617991 ERICH6BQ5W0A0 696 aa16.11■□□□□ 0.17
RAB7B-202ENST00000617991 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa16.1■□□□□ 0.17
RAB7B-202ENST00000617991 SYNJ1O43426 1573 aa16.1■□□□□ 0.17
RAB7B-202ENST00000617991 NBR1Q14596 966 aa16.08■□□□□ 0.17
RAB7B-202ENST00000617991 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
RAB7B-202ENST00000617991 PPP4R2Q9NY27 417 aa16.08■□□□□ 0.16
RAB7B-202ENST00000617991 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
RAB7B-202ENST00000617991 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
RAB7B-202ENST00000617991 ARAP1Q96P48 1450 aa16.06■□□□□ 0.16
RAB7B-202ENST00000617991 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB7B-202ENST00000617991 SIN3AQ96ST3 1273 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB7B-202ENST00000617991 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa16.03■□□□□ 0.16
RAB7B-202ENST00000617991 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RAB7B-202ENST00000617991 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RAB7B-202ENST00000617991 SETD5Q9C0A6 1442 aa16■□□□□ 0.15
RAB7B-202ENST00000617991 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RAB7B-202ENST00000617991 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB7B-202ENST00000617991 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.94■□□□□ 0.14
RAB7B-202ENST00000617991 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.9■□□□□ 0.14
RAB7B-202ENST00000617991 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
RAB7B-202ENST00000617991 IL27Q8NEV9 243 aa15.89■□□□□ 0.13
RAB7B-202ENST00000617991 PRXQ9BXM0 1461 aa15.88■□□□□ 0.13
RAB7B-202ENST00000617991 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
RAB7B-202ENST00000617991 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
RAB7B-202ENST00000617991 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
RAB7B-202ENST00000617991 TONSLQ96HA7 1378 aa15.84■□□□□ 0.13
RAB7B-202ENST00000617991 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
RAB7B-202ENST00000617991 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa15.81■□□□□ 0.12
RAB7B-202ENST00000617991 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
RAB7B-202ENST00000617991 TOP2BQ02880 1626 aa15.8■□□□□ 0.12
RAB7B-202ENST00000617991 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.8■□□□□ 0.12
RAB7B-202ENST00000617991 TIAM1Q13009 1591 aa15.76■□□□□ 0.11
RAB7B-202ENST00000617991 WASHC2AQ641Q2 1341 aa15.75■□□□□ 0.11
RAB7B-202ENST00000617991 ZBED9Q6R2W3 1325 aa15.75■□□□□ 0.11
RAB7B-202ENST00000617991 FAM9BQ8IZU0 186 aa15.75■□□□□ 0.11
RAB7B-202ENST00000617991 PHLDB1Q86UU1 1377 aa15.75■□□□□ 0.11
RAB7B-202ENST00000617991 MAP3K1Q13233 1512 aa15.74■□□□□ 0.11
RAB7B-202ENST00000617991 HMGXB3Q12766 1538 aa15.73■□□□□ 0.11
RAB7B-202ENST00000617991 NCAPD3P42695 1498 aa15.73■□□□□ 0.11
RAB7B-202ENST00000617991 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.73■□□□□ 0.11
RAB7B-202ENST00000617991 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.73■□□□□ 0.11
RAB7B-202ENST00000617991 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa15.72■□□□□ 0.11
RAB7B-202ENST00000617991 CCDC184Q52MB2 194 aa15.71■□□□□ 0.11
RAB7B-202ENST00000617991 USP35Q9P2H5 1018 aa15.7■□□□□ 0.1
RAB7B-202ENST00000617991 NEFMP07197 916 aa15.69■□□□□ 0.1
RAB7B-202ENST00000617991 MRS2Q9HD23 443 aa15.69■□□□□ 0.1
RAB7B-202ENST00000617991 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
RAB7B-202ENST00000617991 KIF27Q86VH2 1401 aa15.67■□□□□ 0.1
RAB7B-202ENST00000617991 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
RAB7B-202ENST00000617991 CNTLNQ9NXG0 1405 aa15.66■□□□□ 0.1
RAB7B-202ENST00000617991 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa15.65■□□□□ 0.1
RAB7B-202ENST00000617991 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
RAB7B-202ENST00000617991 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
RAB7B-202ENST00000617991 CUX1P39880 1505 aa15.64■□□□□ 0.09
RAB7B-202ENST00000617991 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
RAB7B-202ENST00000617991 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
RAB7B-202ENST00000617991 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
RAB7B-202ENST00000617991 AKNAQ7Z591 1439 aa15.62■□□□□ 0.09
RAB7B-202ENST00000617991 NCOA2Q15596 1464 aa15.62■□□□□ 0.09
RAB7B-202ENST00000617991 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
RAB7B-202ENST00000617991 CFTRP13569 1480 aa15.61■□□□□ 0.09
RAB7B-202ENST00000617991 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP15.61■□□□□ 0.09
RAB7B-202ENST00000617991 CCDC18Q5T9S5 1454 aa15.6■□□□□ 0.09
RAB7B-202ENST00000617991 UACAQ9BZF9 1416 aa15.59■□□□□ 0.09
RAB7B-202ENST00000617991 NUDCQ9Y266 331 aa15.59■□□□□ 0.09
RAB7B-202ENST00000617991 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.58■□□□□ 0.09
RAB7B-202ENST00000617991 RNF123Q5XPI4 1314 aa15.57■□□□□ 0.08
RAB7B-202ENST00000617991 BRPF3Q9ULD4 1205 aa15.57■□□□□ 0.08
RAB7B-202ENST00000617991 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
RAB7B-202ENST00000617991 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.55■□□□□ 0.08
RAB7B-202ENST00000617991 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.55■□□□□ 0.08
RAB7B-202ENST00000617991 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
RAB7B-202ENST00000617991 CCDC7Q96M83 1385 aa15.53■□□□□ 0.08
RAB7B-202ENST00000617991 GSE1Q14687 1217 aa15.53■□□□□ 0.08
RAB7B-202ENST00000617991 HFM1A2PYH4 1435 aa15.51■□□□□ 0.07
RAB7B-202ENST00000617991 PDE4AP27815 886 aa15.51■□□□□ 0.07
RAB7B-202ENST00000617991 NCOA1Q15788 1441 aa15.5■□□□□ 0.07
RAB7B-202ENST00000617991 PTPN23Q9H3S7 1636 aa15.48■□□□□ 0.07
RAB7B-202ENST00000617991 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RAB7B-202ENST00000617991 FGD6Q6ZV73 1430 aa15.47■□□□□ 0.07
RAB7B-202ENST00000617991 BACH2Q9BYV9 841 aa15.47■□□□□ 0.07
RAB7B-202ENST00000617991 PRDM2Q13029 1718 aa15.47■□□□□ 0.07
RAB7B-202ENST00000617991 DDRGK1Q96HY6 314 aa15.46■□□□□ 0.07
RAB7B-202ENST00000617991 RSPH6AQ9H0K4 717 aa15.46■□□□□ 0.07
RAB7B-202ENST00000617991 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.45■□□□□ 0.06
RAB7B-202ENST00000617991 P3H3Q8IVL6 736 aa15.45■□□□□ 0.06
RAB7B-202ENST00000617991 MS4A1P11836 297 aa15.45■□□□□ 0.06
RAB7B-202ENST00000617991 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.44■□□□□ 0.06
RAB7B-202ENST00000617991 FMN1Q68DA7 1419 aa15.44■□□□□ 0.06
RAB7B-202ENST00000617991 NAIPQ13075 1403 aa15.44■□□□□ 0.06
RAB7B-202ENST00000617991 PTPRKQ15262 1439 aa15.43■□□□□ 0.06
RAB7B-202ENST00000617991 NFKBIBQ15653 356 aa15.42■□□□□ 0.06
RAB7B-202ENST00000617991 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
RAB7B-202ENST00000617991 IGF1RP08069 1367 aa15.42■□□□□ 0.06
RAB7B-202ENST00000617991 KIF7Q2M1P5 1343 aa15.4■□□□□ 0.06
RAB7B-202ENST00000617991 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.4■□□□□ 0.06
RAB7B-202ENST00000617991 FYCO1Q9BQS8 1478 aa15.39■□□□□ 0.05
RAB7B-202ENST00000617991 EXOC6Q8TAG9 804 aa15.39■□□□□ 0.05
RAB7B-202ENST00000617991 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms