RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614192.4

SCOC-211, Transcript of short coiled-coil protein, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCOC, Length 1,959 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCOC-211ENST00000614192 WDR62O43379 1518 aa25.92■■□□□ 1.74
SCOC-211ENST00000614192 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.91■■□□□ 1.74
SCOC-211ENST00000614192 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
SCOC-211ENST00000614192 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.85■■□□□ 1.73
SCOC-211ENST00000614192 TIAM1Q13009 1591 aa25.85■■□□□ 1.73
SCOC-211ENST00000614192 PBRM1Q86U86 1689 aa25.84■■□□□ 1.73
SCOC-211ENST00000614192 IFT140Q96RY7 1462 aa25.84■■□□□ 1.73
SCOC-211ENST00000614192 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.83■■□□□ 1.73
SCOC-211ENST00000614192 P3H3Q8IVL6 736 aa25.83■■□□□ 1.73
SCOC-211ENST00000614192 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
SCOC-211ENST00000614192 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
SCOC-211ENST00000614192 GRIN2BQ13224 1484 aa25.79■■□□□ 1.72
SCOC-211ENST00000614192 ERCC6Q03468 1493 aa25.76■■□□□ 1.72
SCOC-211ENST00000614192 SAMD9Q5K651 1589 aa25.76■■□□□ 1.72
SCOC-211ENST00000614192 ADAMTS12P58397 1594 aa25.76■■□□□ 1.71
SCOC-211ENST00000614192 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.75■■□□□ 1.71
SCOC-211ENST00000614192 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
SCOC-211ENST00000614192 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.75■■□□□ 1.71
SCOC-211ENST00000614192 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.75■■□□□ 1.71
SCOC-211ENST00000614192 FMN1Q68DA7 1419 aa25.73■■□□□ 1.71
SCOC-211ENST00000614192 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.72■■□□□ 1.71
SCOC-211ENST00000614192 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
SCOC-211ENST00000614192 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.69■■□□□ 1.7
SCOC-211ENST00000614192 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.66■■□□□ 1.7
SCOC-211ENST00000614192 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
SCOC-211ENST00000614192 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
SCOC-211ENST00000614192 IQGAP2Q13576 1575 aa25.6■■□□□ 1.69
SCOC-211ENST00000614192 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.59■■□□□ 1.69
SCOC-211ENST00000614192 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.5■■□□□ 1.67
SCOC-211ENST00000614192 GRIN2AQ12879 1464 aa25.5■■□□□ 1.67
SCOC-211ENST00000614192 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.49■■□□□ 1.67
SCOC-211ENST00000614192 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
SCOC-211ENST00000614192 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.48■■□□□ 1.67
SCOC-211ENST00000614192 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
SCOC-211ENST00000614192 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.43■■□□□ 1.66
SCOC-211ENST00000614192 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.41■■□□□ 1.66
SCOC-211ENST00000614192 SYNJ2O15056 1496 aa25.41■■□□□ 1.66
SCOC-211ENST00000614192 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.41■■□□□ 1.66
SCOC-211ENST00000614192 ITGAEP38570 1179 aa25.4■■□□□ 1.66
SCOC-211ENST00000614192 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.37■■□□□ 1.65
SCOC-211ENST00000614192 DISP1Q96F81 1524 aa25.37■■□□□ 1.65
SCOC-211ENST00000614192 HECW1Q76N89 1606 aa25.36■■□□□ 1.65
SCOC-211ENST00000614192 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
SCOC-211ENST00000614192 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SCOC-211ENST00000614192 KIAA0556O60303 1618 aa25.34■■□□□ 1.65
SCOC-211ENST00000614192 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.34■■□□□ 1.65
SCOC-211ENST00000614192 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.33■■□□□ 1.65
SCOC-211ENST00000614192 CEP170Q5SW79 1584 aa25.32■■□□□ 1.64
SCOC-211ENST00000614192 NCOA2Q15596 1464 aa25.31■■□□□ 1.64
SCOC-211ENST00000614192 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
SCOC-211ENST00000614192 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.3■■□□□ 1.64
SCOC-211ENST00000614192 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.3■■□□□ 1.64
SCOC-211ENST00000614192 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
SCOC-211ENST00000614192 NUP160Q12769 1436 aa25.28■■□□□ 1.64
SCOC-211ENST00000614192 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.28■■□□□ 1.64
SCOC-211ENST00000614192 ARHGEF11O15085 1522 aa25.28■■□□□ 1.64
SCOC-211ENST00000614192 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.26■■□□□ 1.63
SCOC-211ENST00000614192 FBLN2P98095 1184 aa25.23■■□□□ 1.63
SCOC-211ENST00000614192 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SCOC-211ENST00000614192 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SCOC-211ENST00000614192 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SCOC-211ENST00000614192 JPH4Q96JJ6 628 aa25.16■■□□□ 1.62
SCOC-211ENST00000614192 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.15■■□□□ 1.62
SCOC-211ENST00000614192 PTPRKQ15262 1439 aa25.12■■□□□ 1.61
SCOC-211ENST00000614192 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.12■■□□□ 1.61
SCOC-211ENST00000614192 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.11■■□□□ 1.61
SCOC-211ENST00000614192 MAPKBP1O60336 1514 aa25.11■■□□□ 1.61
SCOC-211ENST00000614192 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
SCOC-211ENST00000614192 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SCOC-211ENST00000614192 ARID3CA6NKF2 412 aa25.08■■□□□ 1.61
SCOC-211ENST00000614192 HFM1A2PYH4 1435 aa25.06■■□□□ 1.6
SCOC-211ENST00000614192 MIA2Q96PC5 1412 aa25.06■■□□□ 1.6
SCOC-211ENST00000614192 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.04■■□□□ 1.6
SCOC-211ENST00000614192 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SCOC-211ENST00000614192 NAIPQ13075 1403 aa24.99■■□□□ 1.59
SCOC-211ENST00000614192 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
SCOC-211ENST00000614192 ABCA8O94911 1581 aa24.94■■□□□ 1.58
SCOC-211ENST00000614192 CHD1O14646 1710 aa24.94■■□□□ 1.58
SCOC-211ENST00000614192 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
SCOC-211ENST00000614192 AKNAQ7Z591 1439 aa24.91■■□□□ 1.58
SCOC-211ENST00000614192 UACAQ9BZF9 1416 aa24.9■■□□□ 1.58
SCOC-211ENST00000614192 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.87■■□□□ 1.57
SCOC-211ENST00000614192 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.84■■□□□ 1.57
SCOC-211ENST00000614192 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.84■■□□□ 1.57
SCOC-211ENST00000614192 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.84■■□□□ 1.57
SCOC-211ENST00000614192 SHROOM2Q13796 1616 aa24.84■■□□□ 1.57
SCOC-211ENST00000614192 ATP10BO94823 1461 aa24.84■■□□□ 1.57
SCOC-211ENST00000614192 PTPRGP23470 1445 aa24.83■■□□□ 1.57
SCOC-211ENST00000614192 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.83■■□□□ 1.57
SCOC-211ENST00000614192 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.82■■□□□ 1.56
SCOC-211ENST00000614192 DAPK1P53355 1430 aa24.81■■□□□ 1.56
SCOC-211ENST00000614192 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SCOC-211ENST00000614192 KIF14Q15058 1648 aa24.8■■□□□ 1.56
SCOC-211ENST00000614192 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SCOC-211ENST00000614192 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
SCOC-211ENST00000614192 ABCC5O15440 1437 aa24.79■■□□□ 1.56
SCOC-211ENST00000614192 ROCK1Q13464 1354 aa24.79■■□□□ 1.56
SCOC-211ENST00000614192 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.78■■□□□ 1.56
SCOC-211ENST00000614192 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.78■■□□□ 1.56
SCOC-211ENST00000614192 NEUROD1Q13562 356 aa24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms