RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613049.4

RGS3-231, Transcript of regulator of G protein signaling 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene RGS3, Length 1,726 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RGS3-231	ENST00000613049	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RGS3-231	ENST00000613049	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RGS3-231	ENST00000613049	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		28.77	■■■□□ 2.2
RGS3-231	ENST00000613049	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
RGS3-231	ENST00000613049	ADAMTS12	P58397	1594 aa		28.76	■■■□□ 2.19
RGS3-231	ENST00000613049	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
RGS3-231	ENST00000613049	MAP3K1	Q13233	1512 aa		28.59	■■■□□ 2.17
RGS3-231	ENST00000613049	SAMD9	Q5K651	1589 aa		28.59	■■■□□ 2.17
RGS3-231	ENST00000613049	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.57	■■■□□ 2.16
RGS3-231	ENST00000613049	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		28.57	■■■□□ 2.16
RGS3-231	ENST00000613049	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.54	■■■□□ 2.16
RGS3-231	ENST00000613049	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	28.52	■■■□□ 2.16
RGS3-231	ENST00000613049	P3H3	Q8IVL6	736 aa		28.52	■■■□□ 2.16
RGS3-231	ENST00000613049	TIAM1	Q13009	1591 aa		28.51	■■■□□ 2.15
RGS3-231	ENST00000613049	FMN1	Q68DA7	1419 aa		28.51	■■■□□ 2.15
RGS3-231	ENST00000613049	IQGAP2	Q13576	1575 aa		28.51	■■■□□ 2.15
RGS3-231	ENST00000613049	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		28.5	■■■□□ 2.15
RGS3-231	ENST00000613049	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	28.49	■■■□□ 2.15
RGS3-231	ENST00000613049	FBLN2	P98095	1184 aa		28.48	■■■□□ 2.15
RGS3-231	ENST00000613049	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		28.47	■■■□□ 2.15
RGS3-231	ENST00000613049	GRIN2A	Q12879	1464 aa		28.46	■■■□□ 2.15
RGS3-231	ENST00000613049	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	28.45	■■■□□ 2.14
RGS3-231	ENST00000613049	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		28.43	■■■□□ 2.14
RGS3-231	ENST00000613049	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.43	■■■□□ 2.14
RGS3-231	ENST00000613049	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.4	■■■□□ 2.14
RGS3-231	ENST00000613049	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		28.4	■■■□□ 2.14
RGS3-231	ENST00000613049	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		28.38	■■■□□ 2.13
RGS3-231	ENST00000613049	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		28.37	■■■□□ 2.13
RGS3-231	ENST00000613049	CHD1	O14646	1710 aa		28.32	■■■□□ 2.12
RGS3-231	ENST00000613049	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	28.32	■■■□□ 2.12
RGS3-231	ENST00000613049	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	28.29	■■■□□ 2.12
RGS3-231	ENST00000613049	CEP170	Q5SW79	1584 aa		28.25	■■■□□ 2.11
RGS3-231	ENST00000613049	NUP160	Q12769	1436 aa		28.24	■■■□□ 2.11
RGS3-231	ENST00000613049	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	28.22	■■■□□ 2.11
RGS3-231	ENST00000613049	KIAA0556	O60303	1618 aa		28.21	■■■□□ 2.11
RGS3-231	ENST00000613049	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	28.21	■■■□□ 2.11
RGS3-231	ENST00000613049	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		28.2	■■■□□ 2.11
RGS3-231	ENST00000613049	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	28.2	■■■□□ 2.1
RGS3-231	ENST00000613049	DISP1	Q96F81	1524 aa		28.19	■■■□□ 2.1
RGS3-231	ENST00000613049	HECW1	Q76N89	1606 aa		28.18	■■■□□ 2.1
RGS3-231	ENST00000613049	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		28.16	■■■□□ 2.1
RGS3-231	ENST00000613049	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		28.15	■■■□□ 2.1
RGS3-231	ENST00000613049	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		28.13	■■■□□ 2.09
RGS3-231	ENST00000613049	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		28.11	■■■□□ 2.09
RGS3-231	ENST00000613049	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		28.09	■■■□□ 2.09
RGS3-231	ENST00000613049	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		28.07	■■■□□ 2.08
RGS3-231	ENST00000613049	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		28.04	■■■□□ 2.08
RGS3-231	ENST00000613049	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
RGS3-231	ENST00000613049	JPH4	Q96JJ6	628 aa		28.01	■■■□□ 2.07
RGS3-231	ENST00000613049	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
RGS3-231	ENST00000613049	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		27.98	■■■□□ 2.07
RGS3-231	ENST00000613049	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	27.97	■■■□□ 2.07
RGS3-231	ENST00000613049	NCOA2	Q15596	1464 aa		27.95	■■■□□ 2.06
RGS3-231	ENST00000613049	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		27.94	■■■□□ 2.06
RGS3-231	ENST00000613049	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		27.93	■■■□□ 2.06
RGS3-231	ENST00000613049	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
RGS3-231	ENST00000613049	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		27.91	■■■□□ 2.06
RGS3-231	ENST00000613049	ARHGEF11	O15085	1522 aa		27.91	■■■□□ 2.06
RGS3-231	ENST00000613049	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
RGS3-231	ENST00000613049	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RGS3-231	ENST00000613049	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
RGS3-231	ENST00000613049	ITGAE	P38570	1179 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RGS3-231	ENST00000613049	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RGS3-231	ENST00000613049	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
RGS3-231	ENST00000613049	SHROOM2	Q13796	1616 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RGS3-231	ENST00000613049	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
RGS3-231	ENST00000613049	ABCA8	O94911	1581 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RGS3-231	ENST00000613049	ARID3C	A6NKF2	412 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RGS3-231	ENST00000613049	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RGS3-231	ENST00000613049	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
RGS3-231	ENST00000613049	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		27.73	■■■□□ 2.03
RGS3-231	ENST00000613049	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		27.73	■■■□□ 2.03
RGS3-231	ENST00000613049	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		27.73	■■■□□ 2.03
RGS3-231	ENST00000613049	MIA2	Q96PC5	1412 aa		27.72	■■■□□ 2.03
RGS3-231	ENST00000613049	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
RGS3-231	ENST00000613049	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		27.7	■■■□□ 2.03
RGS3-231	ENST00000613049	PTPRG	P23470	1445 aa		27.7	■■■□□ 2.02
RGS3-231	ENST00000613049	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
RGS3-231	ENST00000613049	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		27.63	■■■□□ 2.01
RGS3-231	ENST00000613049	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RGS3-231	ENST00000613049	ATP10B	O94823	1461 aa		27.59	■■■□□ 2.01
RGS3-231	ENST00000613049	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		27.59	■■■□□ 2.01
RGS3-231	ENST00000613049	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		27.59	■■■□□ 2.01
RGS3-231	ENST00000613049	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		27.59	■■■□□ 2.01
RGS3-231	ENST00000613049	PTPRK	Q15262	1439 aa		27.57	■■■□□ 2
RGS3-231	ENST00000613049	HFM1	A2PYH4	1435 aa		27.56	■■■□□ 2
RGS3-231	ENST00000613049	UACA	Q9BZF9	1416 aa		27.55	■■■□□ 2
RGS3-231	ENST00000613049	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		27.53	■■■□□ 2
RGS3-231	ENST00000613049	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		27.53	■■■□□ 2
RGS3-231	ENST00000613049	KIF14	Q15058	1648 aa		27.51	■■□□□ 1.99
RGS3-231	ENST00000613049	AKNA	Q7Z591	1439 aa		27.48	■■□□□ 1.99
RGS3-231	ENST00000613049	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		27.47	■■□□□ 1.99
RGS3-231	ENST00000613049	ABCC2	Q92887	1545 aa		27.47	■■□□□ 1.99
RGS3-231	ENST00000613049	NAIP	Q13075	1403 aa		27.46	■■□□□ 1.99
RGS3-231	ENST00000613049	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	27.46	■■□□□ 1.99
RGS3-231	ENST00000613049	MAPKBP1	O60336	1514 aa		27.43	■■□□□ 1.98
RGS3-231	ENST00000613049	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	27.42	■■□□□ 1.98
RGS3-231	ENST00000613049	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		27.42	■■□□□ 1.98
RGS3-231	ENST00000613049	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		27.41	■■□□□ 1.98
RGS3-231	ENST00000613049	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	27.4	■■□□□ 1.98

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