RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607361.5

UBA2-210, Transcript of ubiquitin like modifier activating enzyme 2, humanhuman

TSL 2

Gene UBA2, Length 754 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA2-210ENST00000607361 KIF13AQ9H1H9 1805 aa45.15■■■■■ 4.82
UBA2-210ENST00000607361 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP44.87■■■■■ 4.77
UBA2-210ENST00000607361 FAM69CQ0P6D2 419 aa44.87■■■■■ 4.77
UBA2-210ENST00000607361 ADCY10Q96PN6 1610 aa44.86■■■■■ 4.77
UBA2-210ENST00000607361 ABCC10Q5T3U5 1492 aa44.86■■■■■ 4.77
UBA2-210ENST00000607361 IGF1RP08069 1367 aa44.86■■■■■ 4.77
UBA2-210ENST00000607361 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.84■■■■■ 4.77
UBA2-210ENST00000607361 MAPKBP1O60336 1514 aa44.83■■■■■ 4.77
UBA2-210ENST00000607361 KIF27Q86VH2 1401 aa44.82■■■■■ 4.77
UBA2-210ENST00000607361 CUL7Q14999 1698 aa44.79■■■■■ 4.76
UBA2-210ENST00000607361 DIP2BQ9P265 1576 aa44.77■■■■■ 4.76
UBA2-210ENST00000607361 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.56■■■■■ 4.72
UBA2-210ENST00000607361 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP44.55■■■■■ 4.72
UBA2-210ENST00000607361 PTPRGP23470 1445 aa44.53■■■■■ 4.72
UBA2-210ENST00000607361 TSPOAP1O95153 1857 aa44.51■■■■■ 4.72
UBA2-210ENST00000607361 KDM6BO15054 1643 aa44.49■■■■■ 4.71
UBA2-210ENST00000607361 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa44.41■■■■■ 4.7
UBA2-210ENST00000607361 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.4■■■■■ 4.7
UBA2-210ENST00000607361 IQGAP2Q13576 1575 aa44.38■■■■■ 4.69
UBA2-210ENST00000607361 ABCC2Q92887 1545 aa44.35■■■■■ 4.69
UBA2-210ENST00000607361 ASXL2Q76L83 1435 aa44.25■■■■■ 4.67
UBA2-210ENST00000607361 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa44.24■■■■■ 4.67
UBA2-210ENST00000607361 DISP1Q96F81 1524 aa44.21■■■■■ 4.67
UBA2-210ENST00000607361 PLB1Q6P1J6 1458 aa44.2■■■■■ 4.67
UBA2-210ENST00000607361 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa44.19■■■■■ 4.66
UBA2-210ENST00000607361 UACAQ9BZF9 1416 aa44.17■■■■■ 4.66
UBA2-210ENST00000607361 GLI2P10070 1586 aa44.14■■■■■ 4.66
UBA2-210ENST00000607361 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP44.14■■■■■ 4.66
UBA2-210ENST00000607361 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.1■■■■■ 4.65
UBA2-210ENST00000607361 UGGT2Q9NYU1 1516 aa44.06■■■■■ 4.64
UBA2-210ENST00000607361 KDM5BQ9UGL1 1544 aa44.02■■■■■ 4.64
UBA2-210ENST00000607361 KIAA0556O60303 1618 aa43.99■■■■■ 4.63
UBA2-210ENST00000607361 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP43.98■■■■■ 4.63
UBA2-210ENST00000607361 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP43.96■■■■■ 4.63
UBA2-210ENST00000607361 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa43.92■■■■■ 4.62
UBA2-210ENST00000607361 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP43.89■■■■■ 4.62
UBA2-210ENST00000607361 ADGRL1O94910 1474 aa43.81■■■■■ 4.6
UBA2-210ENST00000607361 TEX14Q8IWB6 1497 aa43.79■■■■■ 4.6
UBA2-210ENST00000607361 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.78■■■■■ 4.6
UBA2-210ENST00000607361 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43.75■■■■■ 4.59
UBA2-210ENST00000607361 GOLGA3Q08378 1498 aa43.65■■■■■ 4.58
UBA2-210ENST00000607361 ABCA8O94911 1581 aa43.61■■■■■ 4.57
UBA2-210ENST00000607361 KCNH8Q96L42 1107 aa43.55■■■■■ 4.56
UBA2-210ENST00000607361 PRXQ9BXM0 1461 aa43.54■■■■■ 4.56
UBA2-210ENST00000607361 CD109Q6YHK3 1445 aa43.53■■■■■ 4.56
UBA2-210ENST00000607361 CFAP43Q8NDM7 1665 aa43.5■■■■■ 4.55
UBA2-210ENST00000607361 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa43.48■■■■■ 4.55
UBA2-210ENST00000607361 ARID3CA6NKF2 412 aa43.38■■■■■ 4.53
UBA2-210ENST00000607361 HECW2Q9P2P5 1572 aa43.34■■■■■ 4.53
UBA2-210ENST00000607361 P3H3Q8IVL6 736 aa43.34■■■■■ 4.53
UBA2-210ENST00000607361 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP43.33■■■■■ 4.53
UBA2-210ENST00000607361 ATP10BO94823 1461 aa43.25■■■■■ 4.51
UBA2-210ENST00000607361 KIF21BO75037 1637 aa43.21■■■■■ 4.51
UBA2-210ENST00000607361 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.2■■■■■ 4.51
UBA2-210ENST00000607361 ARAP3Q8WWN8 1544 aa43.16■■■■■ 4.5
UBA2-210ENST00000607361 SAMD9Q5K651 1589 aa43.13■■■■■ 4.5
UBA2-210ENST00000607361 ABCA9Q8IUA7 1624 aa43.11■■■■■ 4.49
UBA2-210ENST00000607361 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.09■■■■■ 4.49
UBA2-210ENST00000607361 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa43.07■■■■■ 4.48
UBA2-210ENST00000607361 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.99■■■■■ 4.47
UBA2-210ENST00000607361 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.99■■■■■ 4.47
UBA2-210ENST00000607361 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.96■■■■■ 4.47
UBA2-210ENST00000607361 RAPGEF3O95398 923 aa42.96■■■■■ 4.47
UBA2-210ENST00000607361 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.96■■■■■ 4.47
UBA2-210ENST00000607361 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
UBA2-210ENST00000607361 NEO1Q92859 1461 aa42.91■■■■■ 4.46
UBA2-210ENST00000607361 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.88■■■■■ 4.45
UBA2-210ENST00000607361 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa42.84■■■■■ 4.45
UBA2-210ENST00000607361 ADAMTSL3P82987 1691 aa42.83■■■■■ 4.45
UBA2-210ENST00000607361 PTPRMP28827 1452 aa42.8■■■■■ 4.44
UBA2-210ENST00000607361 EEA1Q15075 1411 aa42.78■■■■■ 4.44
UBA2-210ENST00000607361 BCORL1Q5H9F3 1711 aa42.71■■■■■ 4.43
UBA2-210ENST00000607361 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP42.71■■■■■ 4.43
UBA2-210ENST00000607361 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.69■■■■■ 4.42
UBA2-210ENST00000607361 MADDQ8WXG6 1647 aa42.67■■■■■ 4.42
UBA2-210ENST00000607361 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP42.62■■■■■ 4.41
UBA2-210ENST00000607361 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa42.62■■■■■ 4.41
UBA2-210ENST00000607361 AKNAQ7Z591 1439 aa42.61■■■■■ 4.41
UBA2-210ENST00000607361 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP42.61■■■■■ 4.419e-22■□□□□ 8.9
UBA2-210ENST00000607361 RICTORQ6R327 1708 aa42.6■■■■■ 4.41
UBA2-210ENST00000607361 FANCAO15360 1455 aa42.6■■■■■ 4.41
UBA2-210ENST00000607361 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.59■■■■■ 4.41
UBA2-210ENST00000607361 TTC37Q6PGP7 1564 aa42.57■■■■■ 4.41
UBA2-210ENST00000607361 CFAP74Q9C0B2 1584 aa42.55■■■■■ 4.4
UBA2-210ENST00000607361 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP42.5■■■■■ 4.39
UBA2-210ENST00000607361 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.5■■■■■ 4.39
UBA2-210ENST00000607361 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
UBA2-210ENST00000607361 LMTK3Q96Q04 1460 aa42.45■■■■■ 4.39
UBA2-210ENST00000607361 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa42.44■■■■■ 4.38
UBA2-210ENST00000607361 YEATS2Q9ULM3 1422 aa42.41■■■■■ 4.38
UBA2-210ENST00000607361 FBXO41Q8TF61 875 aa42.41■■■■■ 4.38
UBA2-210ENST00000607361 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa42.41■■■■■ 4.38
UBA2-210ENST00000607361 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.39■■■■■ 4.38
UBA2-210ENST00000607361 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa42.39■■■■■ 4.38
UBA2-210ENST00000607361 PLPPR3Q6T4P5 718 aa42.36■■■■■ 4.37
UBA2-210ENST00000607361 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.34■■■■■ 4.37
UBA2-210ENST00000607361 HECW1Q76N89 1606 aa42.33■■■■■ 4.37
UBA2-210ENST00000607361 PLCH2O75038 1416 aa42.3■■■■■ 4.36
UBA2-210ENST00000607361 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
UBA2-210ENST00000607361 SCAPERQ9BY12 1400 aa42.29■■■■■ 4.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.3 ms